TRDMT1

TRDMT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1G55
Ідентифікатори
Символи	TRDMT1, DMNT2, DNMT2, MHSAIIP, PUMET, RNMT1, tRNA aspartic acid methyltransferase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602478 MGI: 1274787 HomoloGene: 3249 GeneCards: TRDMT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • tRNA methyltransferase activity • RNA binding • tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • response to amphetamine • Метилювання • tRNA methylation • tRNA modification • tRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1787	13434
Ensembl	ENSG00000107614	ENSMUSG00000026723
UniProt	O14717	O55055
RefSeq (мРНК)	NM_004412 NM_176081 NM_176083 NM_176084 NM_176085 NM_176086 NM_001321006 NM_001321007 NM_001351219 NM_001351220 NM_001351221 NM_001351222 NM_001351223	NM_010067
RefSeq (білок)	NP_001307935 NP_001307936 NP_004403 NP_001338148 NP_001338149 NP_001338150 NP_001338151 NP_001338152	NP_034197
Локус (UCSC)	Хр. 10: 17.14 – 17.2 Mb	Хр. 2: 13.51 – 13.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRDMT1 (англ. TRNA aspartic acid methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 44 597.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPLRVLELY		SGVGGMHHAL		RESCIPAQVV		AAIDVNTVAN		EVYKYNFPHT
QLLAKTIEGI		TLEEFDRLSF		DMILMSPPCQ		PFTRIGRQGD		MTDSRTNSFL
HILDILPRLQ		KLPKYILLEN		VKGFEVSSTR		DLLIQTIENC		GFQYQEFLLS
PTSLGIPNSR		LRYFLIAKLQ		SEPLPFQAPG		QVLMEFPKIE		SVHPQKYAMD
VENKIQEKNV		EPNISFDGSI		QCSGKDAILF		KLETAEEIHR		KNQQDSDLSV
KMLKDFLEDD		TDVNQYLLPP		KSLLRYALLL		DIVQPTCRRS		VCFTKGYGSY
IEGTGSVLQT		AEDVQVENIY		KSLTNLSQEE		QITKLLILKL		RYFTPKEIAN
LLGFPPEFGF		PEKITVKQRY		RLLGNSLNVH		VVAKLIKILY		E

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Yoder J.A., Bestor T.H. (1998). A candidate mammalian DNA methyltransferase related to pmt1p of fission yeast. Hum. Mol. Genet. 7: 279—284. PMID 9425235 DOI:10.1093/hmg/7.2.279
• Van den Wyngaert I., Sprengel J., Kass S.U., Luyten W.H.M.L. (1998). Cloning and analysis of a novel human putative DNA methyltransferase. FEBS Lett. 426: 283—289. PMID 9599025 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00362-7
• Okano M., Xie S., Li E. (1998). Dnmt2 is not required for de novo and maintenance methylation of viral DNA in embryonic stem cells. Nucleic Acids Res. 26: 2536—2540. PMID 9592134 DOI:10.1093/nar/26.11.2536
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Franchina M., Hooper J., Kay P.H. (2001). Five novel alternatively spliced transcripts of DNA (cytosine-5) methyltransferase 2 in human peripheral blood leukocytes. Int. J. Biochem. Cell Biol. 33: 1104—1115. PMID 11551826 DOI:10.1016/S1357-2725(01)00074-7

Див. також

• Хромосома 10