USP1

USP1
Ідентифікатори
Символи	USP1, UBP, ubiquitin specific peptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603478 MGI: 2385198 HomoloGene: 2528 GeneCards: USP1
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • skeletal system development • monoubiquitinated protein deubiquitination • response to UV • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • GO:0100026 Репарація ДНК • regulation of DNA repair • interstrand cross-link repair Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7398	230484
Ensembl	ENSG00000162607	ENSMUSG00000028560
UniProt	O94782	Q8BJQ2
RefSeq (мРНК)	NM_003368 NM_001017415 NM_001017416	NM_001301414 NM_146144 NM_001356424
RefSeq (білок)	NP_001017415 NP_001017416 NP_003359	NP_001288343 NP_666256 NP_001343353
Локус (UCSC)	Хр. 1: 62.44 – 62.45 Mb	Хр. 4: 98.81 – 98.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP1 (англ. Ubiquitin specific peptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 88 207.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGVIPSESN		GLSRGSPSKK		NRLSLKFFQK		KETKRALDFT		DSQENEEKAS
EYRASEIDQV		VPAAQSSPIN		CEKRENLLPF		VGLNNLGNTC		YLNSILQVLY
FCPGFKSGVK		HLFNIISRKK		EALKDEANQK		DKGNCKEDSL		ASYELICSLQ
SLIISVEQLQ		ASFLLNPEKY		TDELATQPRR		LLNTLRELNP		MYEGYLQHDA
QEVLQCILGN		IQETCQLLKK		EEVKNVAELP		TKVEEIPHPK		EEMNGINSIE
MDSMRHSEDF		KEKLPKGNGK		RKSDTEFGNM		KKKVKLSKEH		QSLEENQRQT
RSKRKATSDT		LESPPKIIPK		YISENESPRP		SQKKSRVKIN		WLKSATKQPS
ILSKFCSLGK		ITTNQGVKGQ		SKENECDPEE		DLGKCESDNT		TNGCGLESPG
NTVTPVNVNE		VKPINKGEEQ		IGFELVEKLF		QGQLVLRTRC		LECESLTERR
EDFQDISVPV		QEDELSKVEE		SSEISPEPKT		EMKTLRWAIS		QFASVERIVG
EDKYFCENCH		HYTEAERSLL		FDKMPEVITI		HLKCFAASGL		EFDCYGGGLS
KINTPLLTPL		KLSLEEWSTK		PTNDSYGLFA		VVMHSGITIS		SGHYTASVKV
TDLNSLELDK		GNFVVDQMCE		IGKPEPLNEE		EARGVVENYN		DEEVSIRVGG
NTQPSKVLNK		KNVEAIGLLG		GQKSKADYEL		YNKASNPDKV		ASTAFAENRN
SETSDTTGTH		ESDRNKESSD		QTGINISGFE		NKISYVVQSL		KEYEGKWLLF
DDSEVKVTEE		KDFLNSLSPS		TSPTSTPYLL		FYKKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1