USP21

USP21
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Y5B, 3I3T, 3MTN
Ідентифікатори
Символи	USP21, USP16, USP23, ubiquitin specific peptidase 21
Зовнішні ІД	OMIM: 604729 MGI: 1353665 HomoloGene: 56572 GeneCards: USP21
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • hydrolase activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • thiol-dependent deubiquitinase; • NEDD8-specific protease activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cysteine-type peptidase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма; • компонент клітини;
Біологічний процес	• ubiquitin-dependent protein catabolic process; • протеоліз; • transcription, DNA-templated; • neuron projection development; • histone deubiquitination; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • protein deubiquitination; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	27005
	30941
	ENSG00000143258
	ENSMUSG00000053483
	Q9UK80
	Q9QZL6
	NM_001014443; NM_012475; NM_001319848; NM_001319847; NM_016572
	NM_013919
	NP_001014443; NP_001306776; NP_001306777; NP_036607
	NP_038947
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

USP21 (англ. Ubiquitin specific peptidase 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 565 амінокислот, а молекулярна маса — 62 656^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQASEHRLG	RTREPPVNIQ	PRVGSKLPFA	PRARSKERRN	PASGPNPMLR
PLPPRPGLPD	ERLKKLELGR	GRTSGPRPRG	PLRADHGVPL	PGSPPPTVAL
PLPSRTNLAR	SKSVSSGDLR	PMGIALGGHR	GTGELGAALS	RLALRPEPPT
LRRSTSLRRL	GGFPGPPTLF	SIRTEPPASH	GSFHMISARS	SEPFYSDDKM
AHHTLLLGSG	HVGLRNLGNT	CFLNAVLQCL	SSTRPLRDFC	LRRDFRQEVP
GGGRAQELTE	AFADVIGALW	HPDSCEAVNP	TRFRAVFQKY	VPSFSGYSQQ
DAQEFLKLLM	ERLHLEINRR	GRRAPPILAN	GPVPSPPRRG	GALLEEPELS
DDDRANLMWK	RYLEREDSKI	VDLFVGQLKS	CLKCQACGYR	STTFEVFCDL
SLPIPKKGFA	GGKVSLRDCF	NLFTKEEELE	SENAPVCDRC	RQKTRSTKKL
TVQRFPRILV	LHLNRFSASR	GSIKKSSVGV	DFPLQRLSLG	DFASDKAGSP
VYQLYALCNH	SGSVHYGHYT	ALCRCQTGWH	VYNDSRVSPV	SENQVASSEG
YVLFYQLMQE	PPRCL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, активаторів, регуляторів хроматину, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література[ред. | ред. код]

Smith T.S., Southan C. (2000). Sequencing, tissue distribution and chromosomal assignment of a novel ubiquitin-specific protease USP23. Biochim. Biophys. Acta. 1490: 184—188. PMID 10786635 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00233-X
Gong L., Kamitani T., Millas S., Yeh E.T.H. (2000). Identification of a novel isopeptidase with dual specificity for ubiquitin- and NEDD8-conjugated proteins. J. Biol. Chem. 275: 14212—14216. PMID 10799498 DOI:10.1074/jbc.275.19.14212
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garcia-Santisteban I., Banuelos S., Rodriguez J.A. (2012). A global survey of CRM1-dependent nuclear export sequences in the human deubiquitinase family. Biochem. J. 441: 209—217. PMID 21888622 DOI:10.1042/BJ20111300