USP3

USP3
Ідентифікатори
Символи	USP3, SIH003, UBP, ubiquitin specific peptidase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604728 MGI: 2152450 HomoloGene: 4766 GeneCards: USP3
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0031493 histone binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • Flemming body • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • цитоплазма Біологічний процес • regulation of protein stability • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0007067 мітоз • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone deubiquitination • protein deubiquitination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9960	235441
Ensembl	ENSG00000140455	ENSMUSG00000032376
UniProt	Q9Y6I4	Q91W36
RefSeq (мРНК)	NM_001256702 NM_006537	NM_001302116 NM_001302122 NM_144937
RefSeq (білок)	NP_001243631 NP_006528	NP_001289045 NP_001289051 NP_659186
Локус (UCSC)	Хр. 15: 63.5 – 63.59 Mb	Хр. 9: 66.51 – 66.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP3 (англ. Ubiquitin specific peptidase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 58 897.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MECPHLSSSV		CIAPDSAKFP		NGSPSSWCCS		VCRSNKSPWV		CLTCSSVHCG
RYVNGHAKKH		YEDAQVPLTN		HKKSEKQDKV		QHTVCMDCSS		YSTYCYRCDD
FVVNDTKLGL		VQKVREHLQN		LENSAFTADR		HKKRKLLENS		TLNSKLLKVN
GSTTAICATG		LRNLGNTCFM		NAILQSLSNI		EQFCCYFKEL		PAVELRNGKT
AGRRTYHTRS		QGDNNVSLVE		EFRKTLCALW		QGSQTAFSPE		SLFYVVWKIM
PNFRGYQQQD		AHEFMRYLLD		HLHLELQGGF		NGVSRSAILQ		ENSTLSASNK
CCINGASTVV		TAIFGGILQN		EVNCLICGTE		SRKFDPFLDL		SLDIPSQFRS
KRSKNQENGP		VCSLRDCLRS		FTDLEELDET		ELYMCHKCKK		KQKSTKKFWI
QKLPKVLCLH		LKRFHWTAYL		RNKVDTYVEF		PLRGLDMKCY		LLEPENSGPE
SCLYDLAAVV		VHHGSGVGSG		HYTAYATHEG		RWFHFNDSTV		TLTDEETVVK
AKAYILFYVE		HQAKAGSDKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, регуляторів хроматину, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Sloper-Mould K.E., Eyre H.J., Wang X.-W., Sutherland G.R., Baker R.T. (1999). Characterization and chromosomal localization of USP3, a novel human ubiquitin-specific protease. J. Biol. Chem. 274: 26878—26884. PMID 10480896 DOI:10.1074/jbc.274.38.26878
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15