USP47

USP47
Ідентифікатори
Символи	USP47, TRFP, ubiquitin specific peptidase 47
Зовнішні ІД	OMIM: 614460 MGI: 1922246 HomoloGene: 9929 GeneCards: USP47
Онтологія гена Молекулярна функція • WD40-repeat domain binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904265 deubiquitinase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • negative regulation of apoptotic process • cellular response to UV • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • GO:0100026 Репарація ДНК • positive regulation of cell growth • monoubiquitinated protein deubiquitination • base-excision repair • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of protein stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55031	74996
Ensembl	ENSG00000170242	ENSMUSG00000059263
UniProt	Q96K76	Q8BY87
RefSeq (мРНК)	NM_001282659 NM_017944 NM_001330208	NM_133758 NM_177249 NM_001357952
RefSeq (білок)	NP_001269588 NP_001317137 NP_060414 NP_001359020 NP_001359021 NP_001359022 NP_001359023 NP_001359024 NP_001359025 NP_001359026 NP_001359027 NP_001359028 NP_001359029 NP_001359030 NP_001359031 NP_001359032	NP_598519 NP_796223 NP_001344881 NP_001390423
Локус (UCSC)	Хр. 11: 11.84 – 11.96 Mb	Хр. 7: 111.62 – 111.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP47 (англ. Ubiquitin specific peptidase 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 375 амінокислот, а молекулярна маса — 157 311.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVPGEENQLV		PKEDVFWRCR		QNIFDEMKKK		FLQIENAAEE		PRVLCIIQDT
TNSKTVNERI		TLNLPASTPV		RKLFEDVANK		VGYINGTFDL		VWGNGINTAD
MAPLDHTSDK		SLLDANFEPG		KKNFLHLTDK		DGEQPQILLE		DSSAGEDSVH
DRFIGPLPRE		GSGGSTSDYV		SQSYSYSSIL		NKSETGYVGL		VNQAMTCYLN
SLLQTLFMTP		EFRNALYKWE		FEESEEDPVT		SIPYQLQRLF		VLLQTSKKRA
IETTDVTRSF		GWDSSEAWQQ		HDVQELCRVM		FDALEQKWKQ		TEQADLINEL
YQGKLKDYVR		CLECGYEGWR		IDTYLDIPLV		IRPYGSSQAF		ASVEEALHAF
IQPEILDGPN		QYFCERCKKK		CDARKGLRFL		HFPYLLTLQL		KRFDFDYTTM
HRIKLNDRMT		FPEELDMSTF		IDVEDEKSPQ		TESCTDSGAE		NEGSCHSDQM
SNDFSNDDGV		DEGICLETNS		GTEKISKSGL		EKNSLIYELF		SVMVHSGSAA
GGHYYACIKS		FSDEQWYSFN		DQHVSRITQE		DIKKTHGGSS		GSRGYYSSAF
ASSTNAYMLI		YRLKDPARNA		KFLEVDEYPE		HIKNLVQKER		ELEEQEKRQR
EIERNTCKIK		LFCLHPTKQV		MMENKLEVHK		DKTLKEAVEM		AYKMMDLEEV
IPLDCCRLVK		YDEFHDYLER		SYEGEEDTPM		GLLLGGVKST		YMFDLLLETR
KPDQVFQSYK		PGEVMVKVHV		VDLKAESVAA		PITVRAYLNQ		TVTEFKQLIS
KAIHLPAETM		RIVLERCYND		LRLLSVSSKT		LKAEGFFRSN		KVFVESSETL
DYQMAFADSH		LWKLLDRHAN		TIRLFVLLPE		QSPVSYSKRT		AYQKAGGDSG
NVDDDCERVK		GPVGSLKSVE		AILEESTEKL		KSLSLQQQQD		GDNGDSSKST
ETSDFENIES		PLNERDSSAS		VDNRELEQHI		QTSDPENFQS		EERSDSDVNN
DRSTSSVDSD		ILSSSHSSDT		LCNADNAQIP		LANGLDSHSI		TSSRRTKANE
GKKETWDTAE		EDSGTDSEYD		ESGKSRGEMQ		YMYFKAEPYA		ADEGSGEGHK
WLMVHVDKRI		TLAAFKQHLE		PFVGVLSSHF		KVFRVYASNQ		EFESVRLNET
LSSFSDDNKI		TIRLGRALKK		GEYRVKVYQL		LVNEQEPCKF		LLDAVFAKGM
TVRQSKEELI		PQLREQCGLE		LSIDRFRLRK		KTWKNPGTVF		LDYHIYEEDI
NISSNWEVFL		EVLDGVEKMK		SMSQLAVLSR		RWKPSEMKLD		PFQEVVLESS
SVDELREKLS		EISGIPLDDI		EFAKGRGTFP		CDISVLDIHQ		DLDWNPKVST
LNVWPLYICD		DGAVIFYRDK		TEELMELTDE		QRNELMKKES		SRLQKTGHRV
TYSPRKEKAL		KIYLDGAPNK		DLTQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Peschiaroli A., Skaar J.R., Pagano M., Melino G. (2010). The ubiquitin-specific protease USP47 is a novel beta-TRCP interactor regulating cell survival. Oncogene. 29: 1384—1393. PMID 19966869 DOI:10.1038/onc.2009.430

Див. також

• Хромосома 11