VPS35

VPS35
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2R17
Ідентифікатори
Символи	VPS35, MEM3, PARK17, VPS35 retromer complex component, retromer complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 601501 MGI: 1890467 HomoloGene: 6221 GeneCards: VPS35
Пов'язані генетичні захворювання
Parkinson disease 17, хвороба Паркінсона
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • D1 dopamine receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • мембрана • tubular endosome • retromer complex • lysosomal membrane • early endosome • екзосома • мітохондрія • лізосома • endosome membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • retromer, cargo-selective complex • mitochondrion-derived vesicle • neuron projection • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • late endosome • гіалоплазма • клітинна мембрана • presynapse • postsynapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • regulation of protein stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt protein secretion • Цитопемпсис • negative regulation of late endosome to lysosome transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • regulation of macroautophagy • Wnt signaling pathway • regulation of mitochondrion organization • mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process • positive regulation of dopamine receptor signaling pathway • positive regulation of mitochondrial fission • mitochondrion to lysosome transport • neurotransmitter receptor transport, endosome to plasma membrane • regulation of dendritic spine maintenance • regulation of terminal button organization • lysosome organization • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • protein destabilization • negative regulation of protein homooligomerization • protein localization to organelle • voluntary musculoskeletal movement • positive regulation of locomotion involved in locomotory behavior • positive regulation of dopamine biosynthetic process • negative regulation of protein localization • negative regulation of lysosomal protein catabolic process • GO:0015915 транспорт • GO:0051199 regulation of cellular protein metabolic process • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of cell death • negative regulation of neuron death • regulation of presynapse assembly • intracellular protein transport • synapse assembly • GO:0022415 viral process • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse • protein localization to endosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55737	65114
Ensembl	ENSG00000069329	ENSMUSG00000031696
UniProt	Q96QK1	Q9EQH3
RefSeq (мРНК)	NM_018206	NM_022997
RefSeq (білок)	NP_060676	NP_075373
Локус (UCSC)	Хр. 16: 46.66 – 46.69 Mb	Хр. 8: 85.99 – 86.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VPS35 (англ. VPS35, retromer complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 91 707.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPTTQQSPQD		EQEKLLDEAI		QAVKVQSFQM		KRCLDKNKLM		DALKHASNML
GELRTSMLSP		KSYYELYMAI		SDELHYLEVY		LTDEFAKGRK		VADLYELVQY
AGNIIPRLYL		LITVGVVYVK		SFPQSRKDIL		KDLVEMCRGV		QHPLRGLFLR
NYLLQCTRNI		LPDEGEPTDE		ETTGDISDSM		DFVLLNFAEM		NKLWVRMQHQ
GHSRDREKRE		RERQELRILV		GTNLVRLSQL		EGVNVERYKQ		IVLTGILEQV
VNCRDALAQE		YLMECIIQVF		PDEFHLQTLN		PFLRACAELH		QNVNVKNIII
ALIDRLALFA		HREDGPGIPA		DIKLFDIFSQ		QVATVIQSRQ		DMPSEDVVSL
QVSLINLAMK		CYPDRVDYVD		KVLETTVEIF		NKLNLEHIAT		SSAVSKELTR
LLKIPVDTYN		NILTVLKLKH		FHPLFEYFDY		ESRKSMSCYV		LSNVLDYNTE
IVSQDQVDSI		MNLVSTLIQD		QPDQPVEDPD		PEDFADEQSL		VGRFIHLLRS
EDPDQQYLIL		NTARKHFGAG		GNQRIRFTLP		PLVFAAYQLA		FRYKENSKVD
DKWEKKCQKI		FSFAHQTISA		LIKAELAELP		LRLFLQGALA		AGEIGFENHE
TVAYEFMSQA		FSLYEDEISD		SKAQLAAITL		IIGTFERMKC		FSEENHEPLR
TQCALAASKL		LKKPDQGRAV		STCAHLFWSG		RNTDKNGEEL		HGGKRVMECL
KKALKIANQC		MDPSLQVQLF		IEILNRYIYF		YEKENDAVTI		QVLNQLIQKI
REDLPNLESS		EETEQINKHF		HNTLEHLRLR		RESPESEGPI		YEGLIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Edgar A.J., Polak J.M. (2000). Human homologues of yeast vacuolar protein sorting 29 and 35. Biochem. Biophys. Res. Commun. 277: 622—630. PMID 11062004 DOI:10.1006/bbrc.2000.3727
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Arighi C.N., Hartnell L.M., Aguilar R.C., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2004). Role of the mammalian retromer in sorting of the cation-independent mannose 6-phosphate receptor. J. Cell Biol. 165: 123—133. PMID 15078903 DOI:10.1083/jcb.200312055
• Gokool S., Tattersall D., Seaman M.N. (2007). EHD1 interacts with retromer to stabilize SNX1 tubules and facilitate endosome-to-Golgi retrieval. Traffic. 8: 1873—1886. PMID 17868075 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00652.x
• Seaman M.N., Harbour M.E., Tattersall D., Read E., Bright N. (2009). Membrane recruitment of the cargo-selective retromer subcomplex is catalysed by the small GTPase Rab7 and inhibited by the Rab-GAP TBC1D5. J. Cell Sci. 122: 2371—2382. PMID 19531583 DOI:10.1242/jcs.048686
• Tabuchi M., Yanatori I., Kawai Y., Kishi F. (2010). Retromer-mediated direct sorting is required for proper endosomal recycling of the mammalian iron transporter DMT1. J. Cell Sci. 123: 756—766. PMID 20164305 DOI:10.1242/jcs.060574

Див. також

• Хромосома 16