ZRANB1

ZRANB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZRH, 5AF6
Ідентифікатори
Символи	ZRANB1, TRABID, zinc finger RANBP2-type containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611749 MGI: 106441 HomoloGene: 9728 GeneCards: ZRANB1
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • protein K29-linked deubiquitination • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway • протеоліз • protein K33-linked deubiquitination • positive regulation of Wnt signaling pathway • protein K63-linked deubiquitination • cytoskeleton organization • regulation of cell morphogenesis • cell migration • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54764	360216
Ensembl	ENSG00000019995	ENSMUSG00000030967
UniProt	Q9UGI0	Q7M760
RefSeq (мРНК)	NM_017580	NM_207302 NM_001362198 NM_001362199
RefSeq (білок)	NP_060050	NP_997185 NP_001349127 NP_001349128
Локус (UCSC)	Хр. 10: 124.94 – 124.99 Mb	Хр. 7: 132.53 – 132.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZRANB1 (англ. Zinc finger RANBP2-type containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 80 967.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSERGIKWAC		EYCTYENWPS		AIKCTMCRAQ		RPSGTIITED		PFKSGSSDVG
RDWDPSSTEG		GSSPLICPDS		SARPRVKSSY		SMENANKWSC		HMCTYLNWPR
AIRCTQCLSQ		RRTRSPTESP		QSSGSGSRPV		AFSVDPCEEY		NDRNKLNTRT
QHWTCSVCTY		ENWAKAKRCV		VCDHPRPNNI		EAIELAETEE		ASSIINEQDR
ARWRGSCSSG		NSQRRSPPAT		KRDSEVKMDF		QRIELAGAVG		SKEELEVDFK
KLKQIKNRMK		KTDWLFLNAC		VGVVEGDLAA		IEAYKSSGGD		IARQLTADEV
RLLNRPSAFD		VGYTLVHLAI		RFQRQDMLAI		LLTEVSQQAA		KCIPAMVCPE
LTEQIRREIA		ASLHQRKGDF		ACYFLTDLVT		FTLPADIEDL		PPTVQEKLFD
EVLDRDVQKE		LEEESPIINW		SLELATRLDS		RLYALWNRTA		GDCLLDSVLQ
ATWGIYDKDS		VLRKALHDSL		HDCSHWFYTR		WKDWESWYSQ		SFGLHFSLRE
EQWQEDWAFI		LSLASQPGAS		LEQTHIFVLA		HILRRPIIVY		GVKYYKSFRG
ETLGYTRFQG		VYLPLLWEQS		FCWKSPIALG		YTRGHFSALV		AMENDGYGNR
GAGANLNTDD		DVTITFLPLV		DSERKLLHVH		FLSAQELGNE		EQQEKLLREW
LDCCVTEGGV		LVAMQKSSRR		RNHPLVTQMV		EKWLDRYRQI		RPCTSLSDGE
EDEDDEDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Tran H., Hamada F., Schwarz-Romond T., Bienz M. (2008). Trabid, a new positive regulator of Wnt-induced transcription with preference for binding and cleaving K63-linked ubiquitin chains. Genes Dev. 22: 528—542. PMID 18281465 DOI:10.1101/gad.463208

Див. також

• Хромосома 10