Альфа-субодиниця протеасоми 6

Альфа-субодиниця протеасоми 6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4R3O, 4R67, 1IRU, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMA6, IOTA, PROS27, p27K, proteasome subunit alpha 6, proteasome 20S subunit alpha 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602855 MGI: 1347006 HomoloGene: 2085 GeneCards: PSMA6
Реагує на сполуку
Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activity • NF-kappaB binding • purine ribonucleoside triphosphate binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • Полісома • nuclear matrix • P-body • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • proteasome core complex, alpha-subunit complex • міофібрила • саркомера Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • протеоліз • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • regulation of inflammatory response • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5687	26443
Ensembl	ENSG00000100902	ENSMUSG00000021024
UniProt	P60900	Q9QUM9
RefSeq (мРНК)	NM_001282232 NM_001282233 NM_001282234 NM_002791	NM_011968 NM_001310583
RefSeq (білок)	NP_001269161 NP_001269162 NP_001269163 NP_002782	NP_001297512 NP_036098
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 12: 55.43 – 55.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Альфа-субодиниця протеасоми 6 (англ. Proteasome subunit alpha 6) – білок, який кодується геном PSMA6, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 246 амінокислот, а молекулярна маса — 27 399.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRGSSAGFD		RHITIFSPEG		RLYQVEYAFK		AINQGGLTSV		AVRGKDCAVI
VTQKKVPDKL		LDSSTVTHLF		KITENIGCVM		TGMTADSRSQ		VQRARYEAAN
WKYKYGYEIP		VDMLCKRIAD		ISQVYTQNAE		MRPLGCCMIL		IGIDEEQGPQ
VYKCDPAGYY		CGFKATAAGV		KQTESTSFLE		KKVKKKFDWT		FEQTVETAIT
CLSTVLSIDF		KPSEIEVGVV		TVENPKFRIL		TEAEIDAHLV		ALAERD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kristensen P., Johnsen A.H., Uerkvitz W., Tanaka K., Hendil K.B. (1994). Human proteasome subunits from 2-dimensional gels identified by partial sequencing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1785—1789. PMID 7811265 DOI:10.1006/bbrc.1994.2876

Див. також

• Хромосома 14