Циклін-залежна кіназа 6

CDK6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BI7, 1BI8, 1BLX, 1G3N, 1JOW, 1XO2, 2EUF, 2F2C, 3NUP, 3NUX, 4AUA, 4EZ5, 4TTH
Ідентифікатори
Символи	CDK6, MCPH12, PLSTIRE, cyclin-dependent kinase 6, cyclin dependent kinase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 603368 MGI: 1277162 HomoloGene: 963 GeneCards: CDK6
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, microcephaly 12, primary, autosomal recessive
Реагує на сполуку
palbociclib, trilaciclib, palbociclib, Abemaciclib, at-7519, AZD5438, ribociclib
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • cyclin binding • FBXO family protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • cell projection • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex • ruffle • Центр організації мікротрубочок • Цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма • Нуклеоплазма • cyclin D2-CDK6 complex Біологічний процес • диференціація клітин • lateral ventricle development • фосфорилювання • positive regulation of cell-matrix adhesion • positive regulation of fibroblast proliferation • dentate gyrus development • regulation of erythrocyte differentiation • astrocyte development • negative regulation of cell differentiation • response to virus • negative regulation of cell cycle • negative regulation of osteoblast differentiation • generation of neurons • поділ клітини • regulation of cell motility • protein phosphorylation • negative regulation of epithelial cell proliferation • регуляція експресії генів • клітинний цикл • type B pancreatic cell development • negative regulation of myeloid cell differentiation • negative regulation of cellular senescence • gliogenesis • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of monocyte differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • regulation of cell population proliferation • cell dedifferentiation • G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hematopoietic progenitor cell differentiation • Сигнальний шлях Notch • GO:1901313 positive regulation of gene expression • кровотворення • T cell differentiation in thymus • hematopoietic stem cell differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1021	12571
Ensembl	ENSG00000105810	ENSMUSG00000040274
UniProt	Q00534	Q64261
RefSeq (мРНК)	NM_001145306 NM_001259	NM_009873
RefSeq (білок)	NP_001138778 NP_001250	NP_034003
Локус (UCSC)	Хр. 7: 92.6 – 92.84 Mb	Хр. 5: 3.39 – 3.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDK6 (англ. Cyclin dependent kinase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 36 938.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKDGLCRAD		QQYECVAEIG		EGAYGKVFKA		RDLKNGGRFV		ALKRVRVQTG
EEGMPLSTIR		EVAVLRHLET		FEHPNVVRLF		DVCTVSRTDR		ETKLTLVFEH
VDQDLTTYLD		KVPEPGVPTE		TIKDMMFQLL		RGLDFLHSHR		VVHRDLKPQN
ILVTSSGQIK		LADFGLARIY		SFQMALTSVV		VTLWYRAPEV		LLQSSYATPV
DLWSVGCIFA		EMFRRKPLFR		GSSDVDQLGK		ILDVIGLPGE		EDWPRDVALP
RQAFHSKSAQ		PIEKFVTDID		ELGKDLLLKC		LTFNPAKRIS		AYSALSHPYF
QDLERCKENL		DSHLPPSQNT		SELNTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Meyerson M., Harlow E. (1994). Identification of G1 kinase activity for cdk6, a novel cyclin D partner. Mol. Cell. Biol. 14: 2077—2086. PMID 8114739 DOI:10.1128/MCB.14.3.2077
• Mahony D., Parry D.A., Lees E. (1998). Active cdk6 complexes are predominantly nuclear and represent only a minority of the cdk6 in T cells. Oncogene. 16: 603—611. PMID 9482106 DOI:10.1038/sj.onc.1201570
• Matushansky I., Radparvar F., Skoultchi A.I. (2003). CDK6 blocks differentiation: coupling cell proliferation to the block to differentiation in leukemic cells. Oncogene. 22: 4143—4149. PMID 12833137 DOI:10.1038/sj.onc.1206484
• Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x
• Fujimoto T., Anderson K., Jacobsen S.E., Nishikawa S.I., Nerlov C. (2007). Cdk6 blocks myeloid differentiation by interfering with Runx1 DNA binding and Runx1-C/EBPalpha interaction. EMBO J. 26: 2361—2370. PMID 17431401 DOI:10.1038/sj.emboj.7601675

Див. також

• Хромосома 7