Циклін-залежна кіназа 9

CDK9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BLH, 3BLQ, 3BLR, 3LQ5, 3MI9, 3MIA, 3MY1, 3TN8, 3TNH, 3TNI, 4BCF, 4BCG, 4BCH, 4BCI, 4BCJ, 4EC8, 4EC9, 4IMY, 4OGR, 4OR5
Ідентифікатори
Символи	CDK9, C-2k, CDC2L4, CTK1, PITALRE, TAK, cyclin-dependent kinase 9, cyclin dependent kinase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603251 MGI: 1328368 HomoloGene: 55566 GeneCards: CDK9
Реагує на сполуку
dinaciclib, seliciclib
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • transferase activity • protein kinase activity • 7SK snRNA binding • transcription coactivator binding • snRNA binding • ATP binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein serine/threonine kinase activity • chromatin binding • kinase activity • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • protein kinase binding • cyclin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • мембрана • Нуклеоплазма • transcription elongation factor complex • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • PML body • хромосома • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex Біологічний процес • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy • positive regulation of mRNA 3'-UTR binding • regulation of muscle cell differentiation • negative regulation of mRNA polyadenylation • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of viral transcription • replication fork processing • protein phosphorylation • GO:0033127, GO:2000281, GO:2000817 regulation of histone modification • regulation of mitotic cell cycle • cellular response to DNA damage stimulus • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of DNA repair • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • проліферація • transcription by RNA polymerase II • фосфорилювання • positive regulation of histone H2B ubiquitination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1025	107951
Ensembl	ENSG00000136807	ENSMUSG00000009555
UniProt	P50750	Q99J95
RefSeq (мРНК)	NM_001261	NM_130860
RefSeq (білок)	NP_001252 NP_001252.1	NP_570930
Локус (UCSC)	Хр. 9: 127.79 – 127.79 Mb	Хр. 2: 32.6 – 32.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDK9 (англ. Cyclin dependent kinase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 42 778.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKQYDSVEC		PFCDEVSKYE		KLAKIGQGTF		GEVFKARHRK		TGQKVALKKV
LMENEKEGFP		ITALREIKIL		QLLKHENVVN		LIEICRTKAS		PYNRCKGSIY
LVFDFCEHDL		AGLLSNVLVK		FTLSEIKRVM		QMLLNGLYYI		HRNKILHRDM
KAANVLITRD		GVLKLADFGL		ARAFSLAKNS		QPNRYTNRVV		TLWYRPPELL
LGERDYGPPI		DLWGAGCIMA		EMWTRSPIMQ		GNTEQHQLAL		ISQLCGSITP
EVWPNVDNYE		LYEKLELVKG		QKRKVKDRLK		AYVRDPYALD		LIDKLLVLDP
AQRIDSDDAL		NHDFFWSDPM		PSDLKGMLST		HLTSMFEYLA		PPRRKGSQIT
QQSTNQSRNP		ATTNQTEFER		VF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Best J.L., Presky D.H., Swerlick R.A., Burns D.K., Chu W. (1995). Cloning of a full-length cDNA sequence encoding a cdc2-related protein kinase from human endothelial cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 208: 562—568. PMID 7695608 DOI:10.1006/bbrc.1995.1375
• Liu H., Rice A.P. (2000). Genomic organization and characterization of promoter function of the human CDK9 gene. Gene. 252: 51—59. PMID 10903437 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00215-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wei P., Garber M.E., Fang S.-M., Fischer W.H., Jones K.A. (1998). A novel CDK9-associated C-type cyclin interacts directly with HIV-1 Tat and mediates its high-affinity, loop-specific binding to TAR RNA. Cell. 92: 451—462. PMID 9491887 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80939-3
• Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 DOI:10.1093/emboj/17.24.7395
• Peng J.-M., Zhu Y., Milton J.T., Price D.H. (1998). Identification of multiple cyclin subunits of human P-TEFb. Genes Dev. 12: 755—762. PMID 9499409 DOI:10.1101/gad.12.5.755

Див. також

• Хромосома 9