AGBL5

AGBL5
Ідентифікатори
Символи	AGBL5, CCP5, ATP/GTP binding protein-like 5, ATP/GTP binding protein like 5, RP75, AGBL carboxypeptidase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 615900 MGI: 2441745 HomoloGene: 11053 GeneCards: AGBL5
Пов'язані генетичні захворювання
retinitis pigmentosa 75
Онтологія гена Молекулярна функція • carboxypeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • zinc ion binding • tubulin binding • зв'язування з іоном металу • metallocarboxypeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • веретено поділу • mitotic spindle • midbody • цитоскелет • клітинне ядро • гіалоплазма • microtubule cytoskeleton • intercellular bridge Біологічний процес • протеоліз • protein deglutamylation • protein branching point deglutamylation • defense response to virus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60509	231093
Ensembl	ENSG00000084693	ENSMUSG00000029165
UniProt	Q8NDL9	Q09M02
RefSeq (мРНК)	NM_001035507 NM_021831	NM_001048190 NM_001048191 NM_001048192 NM_001294262 NM_174849 NM_001374737
RefSeq (білок)	NP_001030584 NP_068603	NP_001041657 NP_001281191 NP_777274 NP_001361666 NP_001395007 NP_001395008 NP_001395009 NP_001395010 NP_001395011 NP_001395012 NP_001395013 NP_001395014 NP_001395015 NP_001395016
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.04 – 27.07 Mb	Хр. 5: 31.05 – 31.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

AGBL5 (англ. ATP/GTP binding protein like 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 97 534.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELRCGGLLF		SSRFDSGNLA		HVEKVESLSS		DGEGVGGGAS		ALTSGIASSP
DYEFNVWTRP		DCAETEFENG		NRSWFYFSVR		GGMPGKLIKI		NIMNMNKQSK
LYSQGMAPFV		RTLPTRPRWE		RIRDRPTFEM		TETQFVLSFV		HRFVEGRGAT
TFFAFCYPFS		YSDCQELLNQ		LDQRFPENHP		THSSPLDTIY		YHRELLCYSL
DGLRVDLLTI		TSCHGLREDR		EPRLEQLFPD		TSTPRPFRFA		GKRIFFLSSR
VHPGETPSSF		VFNGFLDFIL		RPDDPRAQTL		RRLFVFKLIP		MLNPDGVVRG
HYRTDSRGVN		LNRQYLKPDA		VLHPAIYGAK		AVLLYHHVHS		RLNSQSSSEH
QPSSCLPPDA		PVSDLEKANN		LQNEAQCGHS		ADRHNAEAWK		QTEPAEQKLN
SVWIMPQQSA		GLEESAPDTI		PPKESGVAYY		VDLHGHASKR		GCFMYGNSFS
DESTQVENML		YPKLISLNSA		HFDFQGCNFS		EKNMYARDRR		DGQSKEGSGR
VAIYKASGII		HSYTLECNYN		TGRSVNSIPA		ACHDNGRASP		PPPPAFPSRY
TVELFEQVGR		AMAIAALDMA		ECNPWPRIVL		SEHSSLTNLR		AWMLKHVRNS
RGLSSTLNVG		VNKKRGLRTP		PKSHNGLPVS		CSENTLSRAR		SFSTGTSAGG
SSSSQQNSPQ		MKNSPSFPFH		GSRPAGLPGL		GSSTQKVTHR		VLGPVREPRS
QDRRRQQQPL		NHRPAGSLAP		SPAPTSSGPA		SSHKLGSCLL		PDSFNIPGSS
CSLLSSGDKP		EAVMVIGKGL		LGTGARMPCI		KTRLQARPRL		GRGSPPTRRG
MKGSSGPTSP		TPRTRESSEL		ELGSCSATPG		LPQARPPRPR		SAPAFSPISC
SLSDSPSWNC		YSRGPLGQPE		VCFVPKSPPL		TVSPRV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, карбоксипептидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rodriguez de la Vega Otazo M., Lorenzo J., Tort O., Aviles F.X., Bautista J.M. (2013). Functional segregation and emerging role of cilia-related cytosolic carboxypeptidases (CCPs). FASEB J. 27: 424—431. PMID 23085998 DOI:10.1096/fj.12-209080

Див. також

• Хромосома 2