APEX2

APEX2
Ідентифікатори
Символи	APEX2, APE2, APEXL2, XTH2, ZGRF2, apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 2
Зовнішні ІД	OMIM: 300773 MGI: 1924872 HomoloGene: 5344 GeneCards: APEX2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • lyase activity • nuclease activity • hydrolase activity • exonuclease activity • endonuclease activity • zinc ion binding • DNA binding • double-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • phosphodiesterase I activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • внутрішньоклітинний • fibrillar center Біологічний процес • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA recombination • cellular response to DNA damage stimulus • base-excision repair • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27301	77622
Ensembl	ENSG00000169188	ENSMUSG00000025269
UniProt	Q9UBZ4	Q68G58
RefSeq (мРНК)	NM_014481 NM_001271748	NM_029943
RefSeq (білок)	NP_001258677 NP_055296	NP_084219
Локус (UCSC)	Хр. X: 55 – 55.01 Mb	Хр. X: 149.3 – 149.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APEX2 (англ. Apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 57 401.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRVVSWNIN		GIRRPLQGVA		NQEPSNCAAV		AVGRILDELD		ADIVCLQETK
VTRDALTEPL		AIVEGYNSYF		SFSRNRSGYS		GVATFCKDNA		TPVAAEEGLS
GLFATQNGDV		GCYGNMDEFT		QEELRALDSE		GRALLTQHKI		RTWEGKEKTL
TLINVYCPHA		DPGRPERLVF		KMRFYRLLQI		RAEALLAAGS		HVIILGDLNT
AHRPIDHWDA		VNLECFEEDP		GRKWMDSLLS		NLGCQSASHV		GPFIDSYRCF
QPKQEGAFTC		WSAVTGARHL		NYGSRLDYVL		GDRTLVIDTF		QASFLLPEVM
GSDHCPVGAV		LSVSSVPAKQ		CPPLCTRFLP		EFAGTQLKIL		RFLVPLEQSP
VLEQSTLQHN		NQTRVQTCQN		KAQVRSTRPQ		PSQVGSSRGQ		KNLKSYFQPS
PSCPQASPDI		ELPSLPLMSA		LMTPKTPEEK		AVAKVVKGQA		KTSEAKDEKE
LRTSFWKSVL		AGPLRTPLCG		GHREPCVMRT		VKKPGPNLGR		RFYMCARPRG
PPTDPSSRCN		FFLWSRPS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Burkovics P., Szukacsov V., Unk I., Haracska L. (2006). Human Ape2 protein has a 3'-5' exonuclease activity that acts preferentially on mismatched base pairs. Nucleic Acids Res. 34: 2508—2515. PMID 16687656 DOI:10.1093/nar/gkl259
• Burkovics P., Hajdu I., Szukacsov V., Unk I., Haracska L. (2009). Role of PCNA-dependent stimulation of 3'-phosphodiesterase and 3'-5' exonuclease activities of human Ape2 in repair of oxidative DNA damage. Nucleic Acids Res. 37: 4247—4255. PMID 19443450 DOI:10.1093/nar/gkp357

Див. також

• Хромосома X