CCR6

CCR6
Ідентифікатори
Символи	CCR6, BN-1, C-C CKR-6, CC-CKR-6, CCR-6, CD196, CKR-L3, CKRL3, CMKBR6, DCR2, DRY6, GPR29, GPRCY4, STRL22, C-C motif chemokine receptor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601835 MGI: 1333797 HomoloGene: 3214 GeneCards: CCR6
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • signal transducer activity; • chemokine receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • C-C chemokine receptor activity; • C-C chemokine binding; • signaling receptor activity; • chemokine binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • внутрішньоклітинний; • cell surface; • sperm midpiece; • sperm flagellum; • sperm principal piece; • sperm plasma membrane; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • positive regulation of epithelial cell migration; • dendritic cell chemotaxis; • cellular defense response; • humoral immune response; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of dendritic cell chemotaxis; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • calcium-mediated signaling; • хемотаксис; • cell chemotaxis; • chemokine-mediated signaling pathway; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • isotype switching to IgA isotypes; • positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation; • lymphocyte migration; • T cell migration; • thymocyte migration; • DN2 thymocyte differentiation; • DN3 thymocyte differentiation; • regulation of T cell migration; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1235
	12458
	ENSG00000112486
	ENSMUSG00000040899
	P51684
	O54689
	NM_031409; NM_004367; NM_001394582
NM_001190333; NM_001190334; NM_001190335; NM_001190336; NM_001190337;
	NM_001190338; NM_009835
	NP_004358; NP_113597
NP_001177262; NP_001177263; NP_001177264; NP_001177265; NP_001177266;
	NP_001177267; NP_033965
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CCR6 (англ. C-C motif chemokine receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 494^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGESMNFSD	VFDSSEDYFV	SVNTSYYSVD	SEMLLCSLQE	VRQFSRLFVP
IAYSLICVFG	LLGNILVVIT	FAFYKKARSM	TDVYLLNMAI	ADILFVLTLP
FWAVSHATGA	WVFSNATCKL	LKGIYAINFN	CGMLLLTCIS	MDRYIAIVQA
TKSFRLRSRT	LPRSKIICLV	VWGLSVIISS	STFVFNQKYN	TQGSDVCEPK
YQTVSEPIRW	KLLMLGLELL	FGFFIPLMFM	IFCYTFIVKT	LVQAQNSKRH
KAIRVIIAVV	LVFLACQIPH	NMVLLVTAAN	LGKMNRSCQS	EKLIGYTKTV
TEVLAFLHCC	LNPVLYAFIG	QKFRNYFLKI	LKDLWCVRRK	YKSSGFSCAG
RYSENISRQT	SETADNDNAS	SFTM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Zaballos A., Varona R., Gutierrez J., Lind P., Marquez G. (1996). Molecular cloning and RNA expression of two new human chemokine receptor-like genes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 846—853. PMID 8886020 DOI:10.1006/bbrc.1996.1595
Liao F., Lee H.-H., Farber J.M. (1997). Cloning of STRL22, a new human gene encoding a G-protein-coupled receptor related to chemokine receptors and located on chromosome 6q27. Genomics. 40: 175—180. PMID 9070937 DOI:10.1006/geno.1996.4544
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ai L.S., Liao F. (2002). Mutating the four extracellular cysteines in the chemokine receptor CCR6 reveals their differing roles in receptor trafficking, ligand binding, and signaling. Biochemistry. 41: 8332—8341. PMID 12081481 DOI:10.1021/bi025855y
Roehrl J., Yang D., Oppenheim J.J., Hehlgans T. (2010). Specific binding and chemotactic activity of mBD4 and its functional orthologue hBD2 to CCR6-expressing cells. J. Biol. Chem. 285: 7028—7034. PMID 20068036 DOI:10.1074/jbc.M109.091090
Ito T., Carson W.F. IV, Cavassani K.A., Connett J.M., Kunkel S.L. (2011). CCR6 as a mediator of immunity in the lung and gut. Exp. Cell Res. 317: 613—619. PMID 21376174 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.12.018

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CCR6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1607 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P51684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CCR6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1607 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P51684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

CCR6

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук