CHKB

CHKB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FEG, 2IG7, 3LQ3
Ідентифікатори
Символи	CHKB, CHETK, CHKL, CK, CKB, CKEKB, EK, EKB, MDCMC, choline kinase beta
Зовнішні ІД	OMIM: 612395 MGI: 1328313 HomoloGene: 88718 GeneCards: CHKB
Пов'язані генетичні захворювання
megaconial type congenital muscular dystrophy
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • ATP binding • kinase activity • choline kinase activity • ethanolamine kinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • phosphatidylcholine biosynthetic process • phosphatidylethanolamine biosynthetic process • фосфорилювання • lipid metabolism • phospholipid biosynthetic process • glycerophospholipid biosynthetic process • CDP-choline pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1120	12651
Ensembl	ENSG00000100288	ENSMUSG00000022617
UniProt	Q9Y259	O55229
RefSeq (мРНК)	NM_152253 NM_005198	NM_007692
RefSeq (білок)	NP_005189	NP_031718
Локус (UCSC)	Хр. 22: 50.58 – 50.6 Mb	Хр. 15: 89.31 – 89.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHKB (англ. Choline kinase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 45 271.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAEATAVAG		SGAVGGCLAK		DGLQQSKCPD		TTPKRRRASS		LSRDAERRAY
QWCREYLGGA		WRRVQPEELR		VYPVSGGLSN		LLFRCSLPDH		LPSVGEEPRE
VLLRLYGAIL		QGVDSLVLES		VMFAILAERS		LGPQLYGVFP		EGRLEQYIPS
RPLKTQELRE		PVLSAAIATK		MAQFHGMEMP		FTKEPHWLFG		TMERYLKQIQ
DLPPTGLPEM		NLLEMYSLKD		EMGNLRKLLE		STPSPVVFCH		NDIQEGNILL
LSEPENADSL		MLVDFEYSSY		NYRGFDIGNH		FCEWVYDYTH		EEWPFYKARP
TDYPTQEQQL		HFIRHYLAEA		KKGETLSQEE		QRKLEEDLLV		EVSRYALASH
FFWGLWSILQ		ASMSTIEFGY		LDYAQSRFQF		YFQQKGQLTS		VHSSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, біосинтез ліпідів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• Yamazaki N., Shinohara Y., Kajimoto K., Shindo M., Terada H. (2000). Novel expression of equivocal messages containing both regions of choline/ethanolamine kinase and muscle type carnitine palmitoyltransferase I. J. Biol. Chem. 275: 31739—31746. PMID 10918069 DOI:10.1074/jbc.M006322200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22