GZMA

GZMA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OP8, 1ORF
Ідентифікатори
Символи	GZMA, CTLA3, HFSP, granzyme A
Зовнішні ІД	OMIM: 140050 MGI: 109266 HomoloGene: 21237 GeneCards: GZMA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • serine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • immunological synapse • extracellular region • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of DNA binding • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • negative regulation of endodeoxyribonuclease activity • Цитоліз • GO:2001216 negative regulation of oxidoreductase activity • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • протеоліз • GO:0097285 апоптоз • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3001	14938
Ensembl	ENSG00000145649	ENSMUSG00000023132
UniProt	P12544	P11032
RefSeq (мРНК)	NM_006144	NM_010370
RefSeq (білок)	NP_006135	NP_034500
Локус (UCSC)	Хр. 5: 55.1 – 55.11 Mb	Хр. 13: 113.23 – 113.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GZMA (англ. Granzyme A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 262 амінокислот, а молекулярна маса — 28 999.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRNSYRFLAS		SLSVVVSLLL		IPEDVCEKII		GGNEVTPHSR		PYMVLLSLDR
KTICAGALIA		KDWVLTAAHC		NLNKRSQVIL		GAHSITREEP		TKQIMLVKKE
FPYPCYDPAT		REGDLKLLQL		MEKAKINKYV		TILHLPKKGD		DVKPGTMCQV
AGWGRTHNSA		SWSDTLREVN		ITIIDRKVCN		DRNHYNFNPV		IGMNMVCAGS
LRGGRDSCNG		DSGSPLLCEG		VFRGVTSFGL		ENKCGDPRGP		GVYILLSKKH
LNWIIMTIKG		AV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, цитоліз, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

• Gershenfeld H.K., Hershberger R.J., Shows T.B., Weissman I.L. (1988). Cloning and chromosomal assignment of a human cDNA encoding a T cell- and natural killer cell-specific trypsin-like serine protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 1184—1188. PMID 3257574 DOI:10.1073/pnas.85.4.1184
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ruike Y., Katsuma S., Hirasawa A., Tsujimoto G. (2007). Glucocorticoid-induced alternative promoter usage for a novel 5' variant of granzyme A. J. Hum. Genet. 52: 172—178. PMID 17180578 DOI:10.1007/s10038-006-0099-9
• Fan Z., Beresford P.J., Oh D.Y., Zhang D., Lieberman J. (2003). Tumor suppressor NM23-H1 is a granzyme A-activated DNase during CTL-mediated apoptosis, and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor. Cell. 112: 659—672. PMID 12628186 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00150-8
• Hink-Schauer C., Estebanez-Perpina E., Kurschus F.C., Bode W., Jenne D.E. (2003). Crystal structure of the apoptosis-inducing human granzyme A dimer. Nat. Struct. Biol. 10: 535—540. PMID 12819770 DOI:10.1038/nsb945
• Hameed A., Lowrey D.M., Lichtenheld M., Podack E.R. (1988). Characterization of three serine esterases isolated from human IL-2 activated killer cells. J. Immunol. 141: 3142—3147. PMID 3262682

Див. також

• Хромосома 5