NIFK

NIFK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AFF
Ідентифікатори
Символи	NIFK, MKI67IP, Nopp34, nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67
Зовнішні ІД	OMIM: 611970 MGI: 1915199 HomoloGene: 49862 GeneCards: NIFK
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • condensed nuclear chromosome • хромосома • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • rRNA transcription • rRNA metabolic process • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84365	67949
Ensembl	ENSG00000155438	ENSMUSG00000026377
UniProt	Q9BYG3	Q91VE6
RefSeq (мРНК)	NM_032390	NM_026472
RefSeq (білок)	NP_115766	NP_080748
Локус (UCSC)	Хр. 2: 121.73 – 121.74 Mb	Хр. 1: 118.25 – 118.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NIFK (англ. Nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 34 222.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATFSGPAGP		ILSLNPQEDV		EFQKEVAQVR		KRITQRKKQE		QLTPGVVYVR
HLPNLLDETQ		IFSYFSQFGT		VTRFRLSRSK		RTGNSKGYAF		VEFESEDVAK
IVAETMNNYL		FGERLLECHF		MPPEKVHKEL		FKDWNIPFKQ		PSYPSVKRYN
RNRTLTQKLR		MEERFKKKER		LLRKKLAKKG		IDYDFPSLIL		QKTESISKTN
RQTSTKGQVL		RKKKKKVSGT		LDTPEKTVDS		QGPTPVCTPT		FLERRKSQVA
ELNDDDKDDE		IVFKQPISCV		KEEIQETQTP		THSRKKRRRS		SNQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Takagi M., Sueishi M., Saiwaki T., Kametaka A., Yoneda Y. (2001). A novel nucleolar protein, NIFK, interacts with the forkhead associated domain of Ki-67 antigen in mitosis. J. Biol. Chem. 276: 25386—25391. PMID 11342549 DOI:10.1074/jbc.M102227200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Li H., Byeon I.-J., Ju Y., Tsai M.-D. (2004). Structure of human Ki67 FHA domain and its binding to a phosphoprotein fragment from hNIFK reveal unique recognition sites and new views to the structural basis of FHA domain functions. J. Mol. Biol. 335: 371—381. PMID 14659764 DOI:10.1016/j.jmb.2003.10.032
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Byeon I.-J., Li H., Song H., Gronenborn A.M., Tsai M.-D. (2005). Sequential phosphorylation and multisite interactions characterize specific target recognition by the FHA domain of Ki67. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 987—993. PMID 16244663 DOI:10.1038/nsmb1008

Див. також

• Хромосома 2