OTUD4

OTUD4
Ідентифікатори
Символи	OTUD4, DUBA6, HIN1, HSHIN1, OTU deubiquitinase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 611744 MGI: 1098801 HomoloGene: 35370 GeneCards: OTUD4
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • RNA binding • GO:0032947 molecular adaptor activity • Lys63-specific deubiquitinase activity Клітинна компонента • компонент клітини • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • protein K48-linked deubiquitination • протеоліз • процес імунної системи • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • вроджений імунітет • protein K63-linked deubiquitination • positive regulation of DNA demethylation • regulation of protein K48-linked deubiquitination • negative regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54726	73945
Ensembl	ENSG00000164164	ENSMUSG00000036990
UniProt	Q01804	B2RRE7
RefSeq (мРНК)	NM_001102653 NM_017493 NM_199324 NM_001366057 NM_001366058	NM_001081164 NM_001256033
RefSeq (білок)	NP_001096123 NP_059963 NP_001352986 NP_001352987	NP_001074633 NP_001242962
Локус (UCSC)	Хр. 4: 145.11 – 145.18 Mb	Хр. 8: 80.37 – 80.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUD4 (англ. OTU deubiquitinase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 124 045.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAAVGVPDG		GDQGGAGPRE		DATPMDAYLR		KLGLYRKLVA		KDGSCLFRAV
AEQVLHSQSR		HVEVRMACIH		YLRENREKFE		AFIEGSFEEY		LKRLENPQEW
VGQVEISALS		LMYRKDFIIY		REPNVSPSQV		TENNFPEKVL		LCFSNGNHYD
IVYPIKYKES		SAMCQSLLYE		LLYEKVFKTD		VSKIVMELDT		LEVADEDNSE
ISDSEDDSCK		SKTAAAAADV		NGFKPLSGNE		QLKNNGNSTS		LPLSRKVLKS
LNPAVYRNVE		YEIWLKSKQA		QQKRDYSIAA		GLQYEVGDKC		QVRLDHNGKF
LNADVQGIHS		ENGPVLVEEL		GKKHTSKNLK		APPPESWNTV		SGKKMKKPST
SGQNFHSDVD		YRGPKNPSKP		IKAPSALPPR		LQHPSGVRQH		AFSSHSSGSQ
SQKFSSEHKN		LSRTPSQIIR		KPDRERVEDF		DHTSRESNYF		GLSPEERREK
QAIEESRLLY		EIQNRDEQAF		PALSSSSVNQ		SASQSSNPCV		QRKSSHVGDR
KGSRRRMDTE		ERKDKDSIHG		HSQLDKRPEP		STLENITDDK		YATVSSPSKS
KKLECPSPAE		QKPAEHVSLS		NPAPLLVSPE		VHLTPAVPSL		PATVPAWPSE
PTTFGPTGVP		APIPVLSVTQ		TLTTGPDSAV		SQAHLTPSPV		PVSIQAVNQP
LMPLPQTLSL		YQDPLYPGFP		CNEKGDRAIV		PPYSLCQTGE		DLPKDKNILR
FFFNLGVKAY		SCPMWAPHSY		LYPLHQAYLA		ACRMYPKVPV		PVYPHNPWFQ
EAPAAQNESD		CTCTDAHFPM		QTEASVNGQM		PQPEIGPPTF		SSPLVIPPSQ
VSESHGQLSY		QADLESETPG		QLLHADYEES		LSGKNMFPQP		SFGPNPFLGP
VPIAPPFFPH		VWYGYPFQGF		IENPVMRQNI		VLPSDEKGEL		DLSLENLDLS
KDCGSVSTVD		EFPEARGEHV		HSLPEASVSS		KPDEGRTEQS		SQTRKADTAL
ASIPPVAEGK		AHPPTQILNR		ERETVPVELE		PKRTIQSLKE		KTEKVKDPKT
AADVVSPGAN		SVDSRVQRPK		EESSEDENEV		SNILRSGRSK		QFYNQTYGSR
KYKSDWGYSG		RGGYQHVRSE		ESWKGQPSRS		RDEGYQYHRN		VRGRPFRGDR
RRSGMGDGHR		GQHT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

• Raineri I., Senn H.-P. (1992). HIV-1 promotor insertion revealed by selective detection of chimeric provirus-host gene transcripts. Nucleic Acids Res. 20: 6261—6266. PMID 1475186 DOI:10.1093/nar/20.23.6261
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 4