OTULIN

OTULIN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZNV, 3ZNX, 3ZNZ, 4KSJ, 4KSK, 4KSL, 4OYK, 4P0B
Ідентифікатори
Символи	OTULIN, FAM105B, GUM, OTU deubiquitinase with linear linkage specificity, AIPDS
Зовнішні ІД	OMIM: 615712 MGI: 3577015 HomoloGene: 106591 GeneCards: OTULIN
Пов'язані генетичні захворювання
otulipenia
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • LUBAC complex • цитоплазма Біологічний процес • процес імунної системи • Wnt signaling pathway • протеоліз • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • Ангіогенез • canonical Wnt signaling pathway • sprouting angiogenesis • protein linear deubiquitination • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • вроджений імунітет • negative regulation of inflammatory response • regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	90268	432940
Ensembl	ENSG00000154124	ENSMUSG00000046034
UniProt	Q96BN8	Q3UCV8
RefSeq (мРНК)	NM_138348	NM_001013792
RefSeq (білок)	NP_612357	NP_001013814
Локус (UCSC)	Хр. 5: 14.66 – 14.7 Mb	Хр. 15: 27.54 – 27.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTULIN (англ. OTU deubiquitinase with linear linkage specificity) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 263.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRGTMPQPE		AWPGASCAET		PAREAAATAR		DGGKAAASGQ		PRPEMQCPAE
HEEDMYRAAD		EIEKEKELLI		HERGASEPRL		SVAPEMDIMD		YCKKEWRGNT
QKATCMKMGY		EEVSQKFTSI		RRVRGDNYCA		LRATLFQAMS		QAVGLPPWLQ
DPELMLLPEK		LISKYNWIKQ		WKLGLKFDGK		NEDLVDKIKE		SLTLLRKKWA
GLAEMRTAEA		RQIACDELFT		NEAEEYSLYE		AVKFLMLNRA		IELYNDKEKG
KEVPFFSVLL		FARDTSNDPG		QLLRNHLNQV		GHTGGLEQVE		MFLLAYAVRH
TIQVYRLSKY		NTEEFITVYP		TDPPKDWPVV		TLIAEDDRHY		NIPVRVCEET
SL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, ангіогенез, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5