RTN4R

RTN4R
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OZN, 1P8T
Ідентифікатори
Символи	RTN4R, NGR, NOGOR, Reticulon 4 receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605566 MGI: 2136886 HomoloGene: 11299 GeneCards: RTN4R
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • neuregulin receptor activity • protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heparin binding • chondroitin sulfate binding • ganglioside GM1 binding • ganglioside GT1b binding • lipid binding • signaling receptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • neuronal cell body • ендоплазматичний ретикулум • anchored component of membrane • neuron projection • екзосома • cell surface • anchored component of external side of plasma membrane • dendritic shaft • membrane raft • аксон • дендрит (нейробіологія) • cell projection • перикаріон • presynapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • neuronal signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of axonogenesis • negative regulation of axon extension • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of neuron projection development • negative regulation of axon regeneration • cell surface receptor signaling pathway • аксоноґенеза • corpus callosum development • positive regulation of Rho protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	65078	65079
Ensembl	ENSG00000040608	ENSMUSG00000043811
UniProt	Q9BZR6	Q99PI8
RefSeq (мРНК)	NM_023004	NM_022982
RefSeq (білок)	NP_075380	NP_075358
Локус (UCSC)	Хр. 22: 20.24 – 20.28 Mb	Хр. 16: 17.95 – 17.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RTN4R (англ. Reticulon 4 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 50 708.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRASAGGSR		LLAWVLWLQA		WQVAAPCPGA		CVCYNEPKVT		TSCPQQGLQA
VPVGIPAASQ		RIFLHGNRIS		HVPAASFRAC		RNLTILWLHS		NVLARIDAAA
FTGLALLEQL		DLSDNAQLRS		VDPATFHGLG		RLHTLHLDRC		GLQELGPGLF
RGLAALQYLY		LQDNALQALP		DDTFRDLGNL		THLFLHGNRI		SSVPERAFRG
LHSLDRLLLH		QNRVAHVHPH		AFRDLGRLMT		LYLFANNLSA		LPTEALAPLR
ALQYLRLNDN		PWVCDCRARP		LWAWLQKFRG		SSSEVPCSLP		QRLAGRDLKR
LAANDLQGCA		VATGPYHPIW		TGRATDEEPL		GLPKCCQPDA		ADKASVLEPG
RPASAGNALK		GRVPPGDSPP		GNGSGPRHIN		DSPFGTLPGS		AEPPLTAVRP
EGSEPPGFPT		SGPRRRPGCS		RKNRTRSHCR		LGQAGSGGGG		TGDSEGSGAL
PSLTCSLTPL		GLALVLWTVL		GPC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Fournier A.E., GrandPre T., Strittmatter S.M. (2001). Identification of a receptor mediating Nogo-66 inhibition of axonal regeneration. Nature. 409: 341—346. PMID 11201742 DOI:10.1038/35053072
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• GrandPre T., Li S., Strittmatter S.M. (2002). Nogo-66 receptor antagonist peptide promotes axonal regeneration. Nature. 417: 547—551. PMID 12037567 DOI:10.1038/417547a
• Liu B.P., Fournier A., GrandPre T., Strittmatter S.M. (2002). Myelin-associated glycoprotein as a functional ligand for the Nogo-66 receptor. Science. 297: 1190—1193. PMID 12089450 DOI:10.1126/science.1073031
• Woolf C.J., Bloechlinger S. (2002). It takes more than two to Nogo. Science. 297: 1132—1134. PMID 12183616 DOI:10.1126/science.1076247

Див. також

• Хромосома 22