SDCBP

SDCBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1N99, 1NTE, 1OBX, 1OBY, 1OBZ, 1R6J, 1V1T, 1W9E, 1W9O, 1W9Q, 1YBO, 4Z33
Ідентифікатори
Символи	SDCBP, MDA-9, ST1, SYCL, TACIP18, MDA9, syndecan binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 602217 MGI: 1337026 HomoloGene: 4110 GeneCards: SDCBP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding; • GO:0005110 frizzled binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • cytoskeletal anchor activity; • interleukin-5 receptor binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • lipid binding; • cadherin binding; • syndecan binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • extracellular vesicle; • blood microparticle; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • focal adhesion; • Меланосома; • Адгезивні контакти; • клітинна мембрана; • міжклітинні контакти; • ендоплазматичний ретикулум; • membrane raft; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • extracellular region; • міжклітинний простір; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • interleukin-5 receptor; • Ядерна мембрана; • azurophil granule lumen; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • positive regulation of extracellular exosome assembly; • negative regulation of receptor internalization; • protein targeting to membrane; • ephrin receptor signaling pathway; • substrate-dependent cell migration, cell extension; • positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation; • positive regulation of JNK cascade; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • regulation of mitotic cell cycle; • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • positive regulation of exosomal secretion; • positive regulation of phosphorylation; • actin cytoskeleton organization; • chemical synaptic transmission; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cell growth; • positive regulation of cell migration; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6386
	53378
	ENSG00000137575
	ENSMUSG00000028249
	O00560
	O08992
NM_001007067; NM_001007068; NM_001007069; NM_001007070; NM_005625;
	NM_001330537; NM_001348339; NM_001348340; NM_001348341
	NM_001098227; NM_016807
NP_001007068; NP_001007069; NP_001007070; NP_001007071; NP_001317466;
	NP_005616; NP_001335268; NP_001335269; NP_001335270
	NP_001091697; NP_058087
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SDCBP (англ. Syndecan binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 298 амінокислот, а молекулярна маса — 32 444^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLYPSLEDL	KVDKVIQAQT	AFSANPANPA	ILSEASAPIP	HDGNLYPRLY
PELSQYMGLS	LNEEEIRANV	AVVSGAPLQG	QLVARPSSIN	YMVAPVTGND
VGIRRAEIKQ	GIREVILCKD	QDGKIGLRLK	SIDNGIFVQL	VQANSPASLV
GLRFGDQVLQ	INGENCAGWS	SDKAHKVLKQ	AFGEKITMTI	RDRPFERTIT
MHKDSTGHVG	FIFKNGKITS	IVKDSSAARN	GLLTEHNICE	INGQNVIGLK
DSQIADILST	SGTVVTITIM	PAFIFEHIIK	RMAPSIMKSL	MDHTIPEV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

Lin J.J., Jiang H., Fisher P.B. (1998). Melanoma differentiation associated gene-9, mda-9, is a human gamma interferon responsive gene. Gene. 207: 105—110. PMID 9511750 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00562-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. (1999). A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 3: 423—433. PMID 10230395 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
Grootjans J.J., Reekmans G., Ceulemans H., David G. (2000). Syntenin-syndecan binding requires syndecan-synteny and the co-operation of both PDZ domains of syntenin. J. Biol. Chem. 275: 19933—19941. PMID 10770943 DOI:10.1074/jbc.M002459200
Friand V., David G., Zimmermann P. (2015). Syntenin and syndecan in the biogenesis of exosomes. Biol. Cell. 107: 331—341. PMID 26032692 DOI:10.1111/boc.201500010
Philley J.V., Kannan A., Dasgupta S. (2016). MDA-9/syntenin control. J. Cell. Physiol. 231: 545—550. PMID 26291527 DOI:10.1002/jcp.25136

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10662 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O00560 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10662 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O00560 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SDCBP

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук