SS18L1

SS18L1
Ідентифікатори
Символи	SS18L1, CREST, LP2261, nBAF chromatin remodeling complex subunit, SS18L1 subunit of BAF chromatin remodeling complex, SMARCL2
Зовнішні ІД	OMIM: 606472 MGI: 2444061 HomoloGene: 9191 GeneCards: SS18L1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001105 transcription coactivator activity Клітинна компонента • nBAF complex • ядерні тільця • центромера • кінетохор • хромосома • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • dendrite development • positive regulation of dendrite morphogenesis • regulation of dendrite development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26039	269397
Ensembl	ENSG00000184402	ENSMUSG00000039086
UniProt	O75177	Q8BW22
RefSeq (мРНК)	NM_001301778 NM_015558 NM_198935	NM_178750
RefSeq (білок)	NP_001288707 NP_945173	NP_848865
Локус (UCSC)	Хр. 20: 62.14 – 62.18 Mb	Хр. 2: 179.68 – 179.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SS18L1 (англ. SS18L1, nBAF chromatin remodeling complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 42 990.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVAFASARP		RGKGEVTQQT		IQKMLDENHH		LIQCILEYQS		KGKTAECTQY
QQILHRNLVY		LATIADSNQN		MQSLLPAPPT		QNMNLGPGAL		TQSGSSQGLH
SQGSLSDAIS		TGLPPSSLLQ		GQIGNGPSHV		SMQQTAPNTL		PTTSMSISGP
GYSHAGPASQ		GVPMQGQGTI		GNYVSRTNIN		MQSNPVSMMQ		QQAATSHYSS
AQGGSQHYQG		QSSIAMMGQG		SQGSSMMGQR		PMAPYRPSQQ		GSSQQYLGQE
EYYGEQYSHS		QGAAEPMGQQ		YYPDGHGDYA		YQQSSYTEQS		YDRSFEESTQ
HYYEGGNSQY		SQQQAGYQQG		AAQQQTYSQQ		QYPSQQSYPG		QQQGYGSAQG
APSQYPGYQQ		GQGQQYGSYR		APQTAPSAQQ		QRPYGYEQGQ		YGNYQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20