STAMBP

STAMBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XZE, 3RZU, 3RZV
Ідентифікатори
Символи	STAMBP, AMSH, MICCAP, STAM binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 606247 MGI: 1917777 HomoloGene: 4719 GeneCards: STAMBP
Пов'язані генетичні захворювання
microcephaly-capillary malformation syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • metallopeptidase activity • Lys63-specific deubiquitinase activity Клітинна компонента • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • early endosome • Борозна розщеплення • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • receptor signaling pathway via JAK-STAT • mitotic cytokinesis • протеоліз • negative regulation of Ras protein signal transduction • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • positive regulation of cell population proliferation • protein deubiquitination • protein K63-linked deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10617	70527
Ensembl	ENSG00000124356	ENSMUSG00000006906
UniProt	O95630	Q9CQ26
RefSeq (мРНК)	NM_006463 NM_201647 NM_213622	NM_024239 NM_001362078 NM_001362079 NM_001362080
RefSeq (білок)	NP_006454 NP_964010 NP_998787 NP_001340896 NP_001340897 NP_001340898 NP_001340899 NP_001340900 NP_001340901 NP_001340902 NP_001340903 NP_001340904 NP_001340905	NP_077201 NP_001349007 NP_001349008 NP_001349009
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 6: 83.52 – 83.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STAMBP (англ. STAM binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 48 077.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDHGDVSLP		PEDRVRALSQ		LGSAVEVNED		IPPRRYFRSG		VEIIRMASIY
SEEGNIEHAF		ILYNKYITLF		IEKLPKHRDY		KSAVIPEKKD		TVKKLKEIAF
PKAEELKAEL		LKRYTKEYTE		YNEEKKKEAE		ELARNMAIQQ		ELEKEKQRVA
QQKQQQLEQE		QFHAFEEMIR		NQELEKERLK		IVQEFGKVDP		GLGGPLVPDL
EKPSLDVFPT		LTVSSIQPSD		CHTTVRPAKP		PVVDRSLKPG		ALSNSESIPT
IDGLRHVVVP		GRLCPQFLQL		ASANTARGVE		TCGILCGKLM		RNEFTITHVL
IPKQSAGSDY		CNTENEEELF		LIQDQQGLIT		LGWIHTHPTQ		TAFLSSVDLH
THCSYQMMLP		ESVAIVCSPK		FQETGFFKLT		DHGLEEISSC		RQKGFHPHSK
DPPLFCSCSH		VTVVDRAVTI		TDLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
• Maytal-Kivity V., Reis N., Hofmann K., Glickman M.H. (2002). MPN+, a putative catalytic motif found in a subset of MPN domain proteins from eukaryotes and prokaryotes, is critical for Rpn11 function. BMC Biochem. 3: 28—28. PMID 12370088 DOI:10.1186/1471-2091-3-28
• McCullough J., Clague M.J., Urbe S. (2004). AMSH is an endosome-associated ubiquitin isopeptidase. J. Cell Biol. 166: 487—492. PMID 15314065 DOI:10.1083/jcb.200401141
• Li H., Seth A.K. (2004). An RNF11: Smurf2 complex mediates ubiquitination of the AMSH protein. Oncogene. 23: 1801—1808. PMID 14755250 DOI:10.1038/sj.onc.1207319

Див. також

• Хромосома 2