THOP1

THOP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S4B, 2O36
Ідентифікатори
Символи	THOP1, EP24.15, MEPD_HUMAN, MP78, TOP, thimet oligopeptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601117 MGI: 1354165 HomoloGene: 55726 GeneCards: THOP1
Онтологія гена Молекулярна функція • пептидний зв'язок • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • metalloendopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний міжмембранний простір • гіалоплазма Біологічний процес • протеоліз • peptide metabolic process • protein polyubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7064	50492
Ensembl	ENSG00000172009	ENSMUSG00000004929
UniProt	P52888	Q8C1A5
RefSeq (мРНК)	NM_003249	NM_022653
RefSeq (білок)	NP_003240	NP_073144
Локус (UCSC)	Хр. 19: 2.79 – 2.82 Mb	Хр. 10: 80.91 – 80.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THOP1 (англ. Thimet oligopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 78 840.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPPAACAGD		MADAASPCSV		VNDLRWDLSA		QQIEERTREL		IEQTKRVYDQ
VGTQEFEDVS		YESTLKALAD		VEVTYTVQRN		ILDFPQHVSP		SKDIRTASTE
ADKKLSEFDV		EMSMREDVYQ		RIVWLQEKVQ		KDSLRPEAAR		YLERLIKLGR
RNGLHLPRET		QENIKRIKKK		LSLLCIDFNK		NLNEDTTFLP		FTLQELGGLP
EDFLNSLEKM		EDGKLKVTLK		YPHYFPLLKK		CHVPETRRKV		EEAFNCRCKE
ENCAILKELV		TLRAQKSRLL		GFHTHADYVL		EMNMAKTSQT		VATFLDELAQ
KLKPLGEQER		AVILELKRAE		CERRGLPFDG		RIRAWDMRYY		MNQVEETRYC
VDQNLLKEYF		PVQVVTHGLL		GIYQELLGLA		FHHEEGASAW		HEDVRLYTAR
DAASGEVVGK		FYLDLYPREG		KYGHAACFGL		QPGCLRQDGS		RQIAIAAMVA
NFTKPTADAP		SLLQHDEVET		YFHEFGHVMH		QLCSQAEFAM		FSGTHVERDF
VEAPSQMLEN		WVWEQEPLLR		MSRHYRTGSA		VPRELLEKLI		ESRQANTGLF
NLRQIVLAKV		DQALHTQTDA		DPAEEYARLC		QEILGVPATP		GTNMPATFGH
LAGGYDAQYY		GYLWSEVYSM		DMFHTRFKQE		GVLNSKVGMD		YRSCILRPGG
SEDASAMLRR		FLGRDPKQDA		FLLSKGLQVG		GCEPEPQVC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Thompson A., Huber G., Malherbe P. (1995). Cloning and functional expression of a metalloendopeptidase from human brain with the ability to cleave a beta-APP substrate peptide. Biochem. Biophys. Res. Commun. 213: 66—73. PMID 7639763 DOI:10.1006/bbrc.1995.2099
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Papastoitsis G., Siman R., Scott R., Abraham C.R. (1994). Identification of a metalloprotease from Alzheimer's disease brain able to degrade the beta-amyloid precursor protein and generate amyloidogenic fragments. Biochemistry. 33: 192—199. PMID 8286339 DOI:10.1021/bi00167a025

Див. також

• Хромосома 19