TRMT1

TRMT1
Ідентифікатори
Символи	TRMT1, TRM1, tRNA methyltransferase 1, MRT68
Зовнішні ІД	OMIM: 611669 MGI: 1289155 HomoloGene: 5632 GeneCards: TRMT1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • tRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • tRNA (guanine-N2-)-methyltransferase activity • RNA binding Клітинна компонента • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • tRNA N2-guanine methylation • Метилювання • tRNA modification • tRNA processing • tRNA methylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55621	212528
Ensembl	ENSG00000104907	ENSMUSG00000001909
UniProt	Q9NXH9	Q3TX08
RefSeq (мРНК)	NM_001136035 NM_001142554 NM_017722 NM_001351760 NM_001351761 NM_001351762	NM_001164559 NM_001164560 NM_198020 NM_001364175 NM_001364176
RefSeq (білок)	NP_001129507 NP_001136026 NP_060192 NP_001338689 NP_001338690 NP_001338691 NP_001129507.1 NP_060192.1	NP_001158031 NP_001158032 NP_932137 NP_001351104 NP_001351105
Локус (UCSC)	Хр. 19: 13.1 – 13.12 Mb	Хр. 8: 85.41 – 85.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRMT1 (англ. TRNA methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 659 амінокислот, а молекулярна маса — 72 234.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQGSSLWLSL		TFRSARVLSR		ARFFEWQSPG		LPNTAAMENG		TGPYGEERPR
EVQETTVTEG		AAKIAFPSAN		EVFYNPVQEF		NRDLTCAVIT		EFARIQLGAK
GIQIKVPGEK		DTQKVVVDLS		EQEEEKVELK		ESENLASGDQ		PRTAAVGEIC
EEGLHVLEGL		AASGLRSIRF		ALEVPGLRSV		VANDASTRAV		DLIRRNVQLN
DVAHLVQPSQ		ADARMLMYQH		QRVSERFDVI		DLDPYGSPAT		FLDAAVQAVS
EGGLLCVTCT		DMAVLAGNSG		ETCYSKYGAM		ALKSRACHEM		ALRIVLHSLD
LRANCYQRFV		VPLLSISADF		YVRVFVRVFT		GQAKVKASAS		KQALVFQCVG
CGAFHLQRLG		KASGVPSGRA		KFSAACGPPV		TPECEHCGQR		HQLGGPMWAE
PIHDLDFVGR		VLEAVSANPG		RFHTSERIRG		VLSVITEELP		DVPLYYTLDQ
LSSTIHCNTP		SLLQLRSALL		HADFRVSLSH		ACKNAVKTDA		PASALWDIMR
CWEKECPVKR		ERLSETSPAF		RILSVEPRLQ		ANFTIREDAN		PSSRQRGLKR
FQANPEANWG		PRPRARPGGK		AADEAMEERR		RLLQNKRKEP		PEDVAQRAAR
LKTFPCKRFK		EGTCQRGDQC		CYSHSPPTPR		VSADAAPDCP		ETSNQTPPGP
GAAAGPGID

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК, тРНК, S-аденозил-L-метіоніном.

Література

• Liu J., Straby K.B. (2000). The human tRNA(m22G26)dimethyltransferase: functional expression and characterization of a cloned hTRM1 gene. Nucleic Acids Res. 28: 3445—3451. PMID 10982862 DOI:10.1093/nar/28.18.3445
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 19