USP11

USP11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4MEL
Ідентифікатори
Символи	USP11, UHX1, ubiquitin specific peptidase 11
Зовнішні ІД	OMIM: 300050 MGI: 2384312 HomoloGene: 31252 GeneCards: USP11
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • хромосома Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8237	236733
Ensembl	ENSG00000102226	ENSMUSG00000031066
UniProt	P51784	Q99K46
RefSeq (мРНК)	NM_004651 NM_001371072	NM_145628 NM_001358931
RefSeq (білок)	NP_001358001	NP_663603 NP_001345860
Локус (UCSC)	Хр. X: 47.23 – 47.25 Mb	Хр. X: 20.57 – 20.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP11 (англ. Ubiquitin specific peptidase 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 817.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVAPRLFGG		LCFRFRDQNP		EVAVEGRLPI		SHSCVGCRRE		RTAMATVAAN
PAAAAAAVAA		AAAVTEDREP		QHEELPGLDS		QWRQIENGES		GRERPLRAGE
SWFLVEKHWY		KQWEAYVQGG		DQDSSTFPGC		INNATLFQDE		INWRLKEGLV
EGEDYVLLPA		AAWHYLVSWY		GLEHGQPPIE		RKVIELPNIQ		KVEVYPVELL
LVRHNDLGKS		HTVQFSHTDS		IGLVLRTARE		RFLVEPQEDT		RLWAKNSEGS
LDRLYDTHIT		VLDAALETGQ		LIIMETRKKD		GTWPSAQLHV		MNNNMSEEDE
DFKGQPGICG		LTNLGNTCFM		NSALQCLSNV		PQLTEYFLNN		CYLEELNFRN
PLGMKGEIAE		AYADLVKQAW		SGHHRSIVPH		VFKNKVGHFA		SQFLGYQQHD
SQELLSFLLD		GLHEDLNRVK		KKEYVELCDA		AGRPDQEVAQ		EAWQNHKRRN
DSVIVDTFHG		LFKSTLVCPD		CGNVSVTFDP		FCYLSVPLPI		SHKRVLEVFF
IPMDPRRKPE		QHRLVVPKKG		KISDLCVALS		KHTGISPERM		MVADVFSHRF
YKLYQLEEPL		SSILDRDDIF		VYEVSGRIEA		IEGSREDIVV		PVYLRERTPA
RDYNNSYYGL		MLFGHPLLVS		VPRDRFTWEG		LYNVLMYRLS		RYVTKPNSDD
EDDGDEKEDD		EEDKDDVPGP		STGGSLRDPE		PEQAGPSSGV		TNRCPFLLDN
CLGTSQWPPR		RRRKQLFTLQ		TVNSNGTSDR		TTSPEEVHAQ		PYIAIDWEPE
MKKRYYDEVE		AEGYVKHDCV		GYVMKKAPVR		LQECIELFTT		VETLEKENPW
YCPSCKQHQL		ATKKLDLWML		PEILIIHLKR		FSYTKFSREK		LDTLVEFPIR
DLDFSEFVIQ		PQNESNPELY		KYDLIAVSNH		YGGMRDGHYT		TFACNKDSGQ
WHYFDDNSVS		PVNENQIESK		AAYVLFYQRQ		DVARRLLSPA		GSSGAPASPA
CSSPPSSEFM		DVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Swanson D.A., Freund C.L., Ploder L., McInnes R.R., Valle D. (1996). A ubiquitin C-terminal hydrolase gene on the proximal short arm of the X chromosome: implications for X-linked retinal disorders. Hum. Mol. Genet. 5: 533—538. PMID 8845848 DOI:10.1093/hmg/5.4.533
• Schoenfeld A.R., Apgar S., Dolios G., Wang R., Aaronson S.A. (2004). BRCA2 is ubiquitinated in vivo and interacts with USP11, a deubiquitinating enzyme that exhibits prosurvival function in the cellular response to DNA damage. Mol. Cell. Biol. 24: 7444—7455. PMID 15314155 DOI:10.1128/MCB.24.17.7444-7455.2004
• Yamaguchi T., Kimura J., Miki Y., Yoshida K. (2007). The deubiquitinating enzyme USP11 controls an IkappaB kinase alpha (IKKalpha)-p53 signaling pathway in response to tumor necrosis factor alpha (TNFalpha). J. Biol. Chem. 282: 33943—33948. PMID 17897950 DOI:10.1074/jbc.M706282200
• Lin C.H., Chang H.S., Yu W.C. (2008). USP11 stabilizes HPV-16E7 and further modulates the E7 biological activity. J. Biol. Chem. 283: 15681—15688. PMID 18408009 DOI:10.1074/jbc.M708278200
• Maertens G.N., El Messaoudi-Aubert S., Elderkin S., Hiom K., Peters G. (2010). Ubiquitin-specific proteases 7 and 11 modulate Polycomb regulation of the INK4a tumour suppressor. EMBO J. 29: 2553—2565. PMID 20601937 DOI:10.1038/emboj.2010.129

Див. також

• Хромосома X