USP18

USP18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5CHT, 5CHV
Ідентифікатори
Символи	USP18, ISG43, UBP43, ubiquitin specific peptidase 18, PTORCH2
Зовнішні ІД	OMIM: 607057 MGI: 1344364 HomoloGene: 8047 GeneCards: USP18
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • ISG15-specific protease activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • regulation of inflammatory response • regulation of protein stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11274	24110
Ensembl	ENSG00000184979	ENSMUSG00000030107
UniProt	Q9UMW8	Q9WTV6
RefSeq (мРНК)	NM_017414	NM_011909
RefSeq (білок)	NP_059110	NP_036039
Локус (UCSC)	Хр. 22: 18.15 – 18.18 Mb	Хр. 6: 121.22 – 121.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP18 (англ. Ubiquitin specific peptidase 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 43 011.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKAFGLLRQ		ICQSILAESS		QSPADLEEKK		EEDSNMKREQ		PRERPRAWDY
PHGLVGLHNI		GQTCCLNSLI		QVFVMNVDFT		RILKRITVPR		GADEQRRSVP
FQMLLLLEKM		QDSRQKAVRP		LELAYCLQKC		NVPLFVQHDA		AQLYLKLWNL
IKDQITDVHL		VERLQALYTI		RVKDSLICVD		CAMESSRNSS		MLTLPLSLFD
VDSKPLKTLE		DALHCFFQPR		ELSSKSKCFC		ENCGKKTRGK		QVLKLTHLPQ
TLTIHLMRFS		IRNSQTRKIC		HSLYFPQSLD		FSQILPMKRE		SCDAEEQSGG
QYELFAVIAH		VGMADSGHYC		VYIRNAVDGK		WFCFNDSNIC		LVSWEDIQCT
YGNPNYHWQE		TAYLLVYMKM		EC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Malakhov M.P., Malakhova O.A., Kim K.I., Ritchie K.J., Zhang D.-E. (2002). UBP43 (USP18) specifically removes ISG15 from conjugated proteins. J. Biol. Chem. 277: 9976—9981. PMID 11788588 DOI:10.1074/jbc.M109078200
• Burkart C., Fan J.B., Zhang D.E. (2012). Two independent mechanisms promote expression of an N-terminal truncated USP18 isoform with higher DeISGylation activity in the nucleus. J. Biol. Chem. 287: 4883—4893. PMID 22170061 DOI:10.1074/jbc.M111.255570

Див. також

• Хромосома 22