USP19

USP19
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WH0, 4X3G
Ідентифікатори
Символи	USP19, ZMYND9, ubiquitin specific peptidase 19
Зовнішні ІД	OMIM: 614471 MGI: 1918722 HomoloGene: 41730 GeneCards: USP19
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • Lys48-specific deubiquitinase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • protein K48-linked deubiquitination • regulation of protein stability • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein stabilization • response to endoplasmic reticulum stress • протеоліз • regulation of ERAD pathway • regulation of cellular response to hypoxia • negative regulation of skeletal muscle tissue development • positive regulation of cell cycle process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • negative regulation of proteasomal protein catabolic process • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10869	71472
Ensembl	ENSG00000172046	ENSMUSG00000006676
UniProt	O94966	Q3UJD6
RefSeq (мРНК)	NM_001199160 NM_001199161 NM_001199162 NM_006677 NM_001351098 NM_001351099 NM_001351100 NM_001351101 NM_001351102 NM_001351103 NM_001351104 NM_001351105 NM_001351106 NM_001351107 NM_001351108 NM_001389594 NM_001389595 NM_001389596 NM_001389597 NM_001389598 NM_001389599 NM_001389600 NM_001389601 NM_001389602 NM_001389603 NM_001389604 NM_001389605 NM_001389606 NM_001389607 NM_001389608 NM_001400288 NM_001400290 NM_001400292 NM_001400293 NM_001400294 NM_001400295 NM_001400296 NM_001400297 NM_001400298 NM_001400299	NM_001168371 NM_001168372 NM_001168373 NM_027804 NM_145407
RefSeq (білок)	NP_001186089 NP_001186090 NP_001186091 NP_006668 NP_001338027 NP_001338028 NP_001338029 NP_001338030 NP_001338031 NP_001338032 NP_001338033 NP_001338034 NP_001338035 NP_001338036 NP_001338037	NP_001161843 NP_001161844 NP_001161845 NP_082080 NP_663382
Локус (UCSC)	Хр. 3: 49.11 – 49.12 Mb	Хр. 9: 108.37 – 108.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP19 (англ. Ubiquitin specific peptidase 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 318 амінокислот, а молекулярна маса — 145 651.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGGASATGP		RRGPPGLEDT		TSKKKQKDRA		NQESKDGDPR		KETGSRYVAQ
AGLEPLASGD		PSASASHAAG		ITGSRHRTRL		FFPSSSGSAS		TPQEEQTKEG
ACEDPHDLLA		TPTPELLLDW		RQSAEEVIVK		LRVGVGPLQL		EDVDAAFTDT
DCVVRFAGGQ		QWGGVFYAEI		KSSCAKVQTR		KGSLLHLTLP		KKVPMLTWPS
LLVEADEQLC		IPPLNSQTCL		LGSEENLAPL		AGEKAVPPGN		DPVSPAMVRS
RNPGKDDCAK		EEMAVAADAA		TLVDEPESMV		NLAFVKNDSY		EKGPDSVVVH
VYVKEICRDT		SRVLFREQDF		TLIFQTRDGN		FLRLHPGCGP		HTTFRWQVKL
RNLIEPEQCT		FCFTASRIDI		CLRKRQSQRW		GGLEAPAARV		GGAKVAVPTG
PTPLDSTPPG		GAPHPLTGQE		EARAVEKDKS		KARSEDTGLD		SVATRTPMEH
VTPKPETHLA		SPKPTCMVPP		MPHSPVSGDS		VEEEEEEEKK		VCLPGFTGLV
NLGNTCFMNS		VIQSLSNTRE		LRDFFHDRSF		EAEINYNNPL		GTGGRLAIGF
AVLLRALWKG		THHAFQPSKL		KAIVASKASQ		FTGYAQHDAQ		EFMAFLLDGL
HEDLNRIQNK		PYTETVDSDG		RPDEVVAEEA		WQRHKMRNDS		FIVDLFQGQY
KSKLVCPVCA		KVSITFDPFL		YLPVPLPQKQ		KVLPVFYFAR		EPHSKPIKFL
VSVSKENSTA		SEVLDSLSQS		VHVKPENLRL		AEVIKNRFHR		VFLPSHSLDT
VSPSDTLLCF		ELLSSELAKE		RVVVLEVQQR		PQVPSVPISK		CAACQRKQQS
EDEKLKRCTR		CYRVGYCNQL		CQKTHWPDHK		GLCRPENIGY		PFLVSVPASR
LTYARLAQLL		EGYARYSVSV		FQPPFQPGRM		ALESQSPGCT		TLLSTGSLEA
GDSERDPIQP		PELQLVTPMA		EGDTGLPRVW		AAPDRGPVPS		TSGISSEMLA
SGPIEVGSLP		AGERVSRPEA		AVPGYQHPSE		AMNAHTPQFF		IYKIDSSNRE
QRLEDKGDTP		LELGDDCSLA		LVWRNNERLQ		EFVLVASKEL		ECAEDPGSAG
EAARAGHFTL		DQCLNLFTRP		EVLAPEEAWY		CPQCKQHREA		SKQLLLWRLP
NVLIVQLKRF		SFRSFIWRDK		INDLVEFPVR		NLDLSKFCIG		QKEEQLPSYD
LYAVINHYGG		MIGGHYTACA		RLPNDRSSQR		SDVGWRLFDD		STVTTVDESQ
VVTRYAYVLF		YRRRNSPVER		PPRAGHSEHH		PDLGPAAEAA		ASQASRIWQE
LEAEEEPVPE		GSGPLGPWGP		QDWVGPLPRG		PTTPDEGCLR		YFVLGTVAAL
VALVLNVFYP		LVSQSRWR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mei Y., Hahn A.A., Hu S., Yang X. (2011). The USP19 deubiquitinase regulates the stability of c-IAP1 and c-IAP2. J. Biol. Chem. 286: 35380—35387. PMID 21849505 DOI:10.1074/jbc.M111.282020

Див. також

• Хромосома 3