USP46

USP46
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5CVM, 5CVN, 5CVO
Ідентифікатори
Символи	USP46, ubiquitin specific peptidase 46
Зовнішні ІД	OMIM: 612849 MGI: 1916977 HomoloGene: 56957 GeneCards: USP46
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • GO:0070122 peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • зв'язування з іоном металу • GO:1904265 deubiquitinase activity • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • синапс • glutamatergic synapse Біологічний процес • behavioral response to ethanol • ubiquitin-dependent protein catabolic process • righting reflex • протеоліз • adult feeding behavior • behavioral fear response • protein deubiquitination • regulation of synaptic transmission, GABAergic • GO:0035737 поведінка тварин • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor internalization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64854	69727
Ensembl	ENSG00000109189	ENSMUSG00000054814
UniProt	P62068	P62069
RefSeq (мРНК)	NM_022832 NM_001134223 NM_001286767 NM_001286768	NM_177561
RefSeq (білок)	NP_001127695 NP_001273696 NP_001273697 NP_073743	NP_808229
Локус (UCSC)	Хр. 4: 52.59 – 52.66 Mb	Хр. 5: 74.16 – 74.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP46 (англ. Ubiquitin specific peptidase 46) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 42 442.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTVRNIASIC		NMGTNASALE		KDIGPEQFPI		NEHYFGLVNF		GNTCYCNSVL
QALYFCRPFR		ENVLAYKAQQ		KKKENLLTCL		ADLFHSIATQ		KKKVGVIPPK
KFISRLRKEN		DLFDNYMQQD		AHEFLNYLLN		TIADILQEEK		KQEKQNGKLK
NGNMNEPAEN		NKPELTWVHE		IFQGTLTNET		RCLNCETVSS		KDEDFLDLSV
DVEQNTSITH		CLRDFSNTET		LCSEQKYYCE		TCCSKQEAQK		RMRVKKLPMI
LALHLKRFKY		MEQLHRYTKL		SYRVVFPLEL		RLFNTSSDAV		NLDRMYDLVA
VVVHCGSGPN		RGHYITIVKS		HGFWLLFDDD		IVEKIDAQAI		EEFYGLTSDI
SKNSESGYIL		FYQSRE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cohn M.A., Kee Y., Haas W., Gygi S.P., D'Andrea A.D. (2009). UAF1 is a subunit of multiple deubiquitinating enzyme complexes. J. Biol. Chem. 284: 5343—5351. PMID 19075014 DOI:10.1074/jbc.M808430200
• Dharadhar S., Clerici M., van Dijk W.J., Fish A., Sixma T.K. (2016). A conserved two-step binding for the UAF1 regulator to the USP12 deubiquitinating enzyme. J. Struct. Biol. 196: 437—447. PMID 27650958 DOI:10.1016/j.jsb.2016.09.011

Див. також

• Хромосома 4