VCPIP1

VCPIP1
Ідентифікатори
Символи	VCPIP1, DUBA3, VCIP135, valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1, valosin containing protein interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611745 MGI: 1917925 HomoloGene: 11814 GeneCards: VCPIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • Golgi stack • комплекс Ґольджі • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum lumen Біологічний процес • endoplasmic reticulum membrane fusion • protein K48-linked deubiquitination • Golgi organization • Убіквітин-залежний протеоліз • protein K11-linked deubiquitination • протеоліз • Golgi reassembly • GO:0007067 мітоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80124	70675
Ensembl	ENSG00000175073	ENSMUSG00000045210
UniProt	Q96JH7	Q8CDG3
RefSeq (мРНК)	NM_025054	NM_173443
RefSeq (білок)	NP_079330	NP_775619
Локус (UCSC)	Хр. 8: 66.63 – 66.67 Mb	Хр. 1: 9.79 – 9.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

VCPIP1 (англ. Valosin containing protein interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 222 амінокислот, а молекулярна маса — 134 321.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQPPPPPPP		LPPPPPPPEA		PQTPSSLASA		AASGGLLKRR		DRRILSGSCP
DPKCQARLFF		PASGSVSIEC		TECGQRHEQQ		QLLGVEEVTD		PDVVLHNLLR
NALLGVTGAP		KKNTELVKVM		GLSNYHCKLL		SPILARYGMD		KQTGRAKLLR
DMNQGELFDC		ALLGDRAFLI		EPEHVNTVGY		GKDRSGSLLY		LHDTLEDIKR
ANKSQECLIP		VHVDGDGHCL		VHAVSRALVG		RELFWHALRE		NLKQHFQQHL
ARYQALFHDF		IDAAEWEDII		NECDPLFVPP		EGVPLGLRNI		HIFGLANVLH
RPIILLDSLS		GMRSSGDYSA		TFLPGLIPAE		KCTGKDGHLN		KPICIAWSSS
GRNHYIPLVG		IKGAALPKLP		MNLLPKAWGV		PQDLIKKYIK		LEEDGGCVIG
GDRSLQDKYL		LRLVAAMEEV		FMDKHGIHPS		LVADVHQYFY		RRTGVIGVQP
EEVTAAAKKA		VMDNRLHKCL		LCGALSELHV		PPEWLAPGGK		LYNLAKSTHG
QLRTDKNYSF		PLNNLVCSYD		SVKDVLVPDY		GMSNLTACNW		CHGTSVRKVR
GDGSIVYLDG		DRTNSRSTGG		KCGCGFKHFW		DGKEYDNLPE		AFPITLEWGG
RVVRETVYWF		QYESDSSLNS		NVYDVAMKLV		TKHFPGEFGS		EILVQKVVHT
ILHQTAKKNP		DDYTPVNIDG		AHAQRVGDVQ		GQESESQLPT		KIILTGQKTK
TLHKEELNMS		KTERTIQQNI		TEQASVMQKR		KTEKLKQEQK		GQPRTVSPST
IRDGPSSAPA		TPTKAPYSPT		TSKEKKIRIT		TNDGRQSMVT		LKSSTTFFEL
QESIAREFNI		PPYLQCIRYG		FPPKELMPPQ		AGMEKEPVPL		QHGDRITIEI
LKSKAEGGQS		AAAHSAHTVK		QEDIAVTGKL		SSKELQEQAE		KEMYSLCLLA
TLMGEDVWSY		AKGLPHMFQQ		GGVFYSIMKK		TMGMADGKHC		TFPHLPGKTF
VYNASEDRLE		LCVDAAGHFP		IGPDVEDLVK		EAVSQVRAEA		TTRSRESSPS
HGLLKLGSGG		VVKKKSEQLH		NVTAFQGKGH		SLGTASGNPH		LDPRARETSV
VRKHNTGTDF		SNSSTKTEPS		VFTASSSNSE		LIRIAPGVVT		MRDGRQLDPD
LVEAQRKKLQ		EMVSSIQASM		DRHLRDQSTE		QSPSDLPQRK		TEVVSSSAKS
GSLQTGLPES		FPLTGGTENL		NTETTDGCVA		DALGAAFATR		SKAQRGNSVE
ELEEMDSQDA		EMTNTTEPMD		HS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8