ASTN2

ASTN2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5J68, 5J69, 5J67
Ідентифікатори
Символи	ASTN2, bA67K19.1, astrotactin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612856 MGI: 1889277 HomoloGene: 77850 GeneCards: ASTN2
Пов'язані генетичні захворювання
migraine without aura, ожиріння, мігрень, сибірка, розлад дефіциту уваги та гіперактивності
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • inositol 1,3,4,5 tetrakisphosphate binding Клітинна компонента • ендосома • мембрана • integral component of membrane • cell pole • cell cortex • цитоплазма • early endosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • перикаріон • clathrin-coated vesicle • late endosome Біологічний процес • negative regulation of protein localization to cell surface • protein transport • establishment of body hair planar orientation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23245	56079
Ensembl	ENSG00000148219	ENSMUSG00000028373
UniProt	O75129	Q80Z10
RefSeq (мРНК)	NM_198188 NM_001184734 NM_001184735 NM_014010 NM_198186 NM_198187 NM_001365068 NM_001365069	NM_019514 NM_207109
RefSeq (білок)	NP_001171663 NP_001171664 NP_054729 NP_937829 NP_937830 NP_937831 NP_001351997 NP_001351998 NP_001171663.1	NP_062387 NP_996992
Локус (UCSC)	Хр. 9: 116.42 – 117.42 Mb	Хр. 4: 65.3 – 66.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ASTN2 (англ. Astrotactin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 339 амінокислот, а молекулярна маса — 148 243.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAGARLSP		GPGSGLRGRP		RLCFHPGPPP		LLPLLLLFLL		LLPPPPLLAG
ATAAASREPD		SPCRLKTVTV		STLPALRESD		IGWSGARAGA		GAGTGAGAAA
AAASPGSPGS		AGTAAESRLL		LFVRNELPGR		IAVQDDLDNT		ELPFFTLEMS
GTAADISLVH		WRQQWLENGT		LYFHVSMSSS		GQLAQATAPT		LQEPSEIVEE
QMHILHISVM		GGLIALLLLL		LVFTVALYAQ		RRWQKRRRIP		QKSASTEATH
EIHYIPSVLL		GPQARESFRS		SRLQTHNSVI		GVPIRETPIL		DDYDCEEDEE
PPRRANHVSR		EDEFGSQVTH		TLDSLGHPGE		EKVDFEKKAA		AEATQETVES
LMQKFKESFR		ANTPIEIGQL		QPPLRSTSAG		KRKRRSKSRG		GISFGRAKGT
SGSEADDETQ		LTFYTEQYRS		RRRSKGLLKS		PVNKTALTLI		AVSSCILAMV
CGSQMSCPLT		VKVTLHVPEH		FIADGSSFVV		SEGSYLDISD		WLNPAKLSLY
YQINATSPWV		RDLCGQRTTD		ACEQLCDPET		GECSCHEGYA		PDPVHRHLCV
RSDWGQSEGP		WPYTTLERGY		DLVTGEQAPE		KILRSTFSLG		QGLWLPVSKS
FVVPPVELSI		NPLASCKTDV		LVTEDPADVR		EEAMLSTYFE		TINDLLSSFG
PVRDCSRNNG		GCTRNFKCVS		DRQVDSSGCV		CPEELKPMKD		GSGCYDHSKG
IDCSDGFNGG		CEQLCLQQTL		PLPYDATSST		IFMFCGCVEE		YKLAPDGKSC
LMLSDVCEGP		KCLKPDSKFN		DTLFGEMLHG		YNNRTQHVNQ		GQVFQMTFRE
NNFIKDFPQL		ADGLLVIPLP		VEEQCRGVLS		EPLPDLQLLT		GDIRYDEAMG
YPMVQQWRVR		SNLYRVKLST		ITLAAGFTNV		LKILTKESSR		EELLSFIQHY
GSHYIAEALY		GSELTCIIHF		PSKKVQQQLW		LQYQKETTEL		GSKKELKSMP
FITYLSGLLT		AQMLSDDQLI		SGVEIRCEEK		GRCPSTCHLC		RRPGKEQLSP
TPVLLEINRV		VPLYTLIQDN		GTKEAFKSAL		MSSYWCSGKG		DVIDDWCRCD
LSAFDANGLP		NCSPLLQPVL		RLSPTVEPSS		TVVSLEWVDV		QPAIGTKVSD
YILQHKKVDE		YTDTDLYTGE		FLSFADDLLS		GLGTSCVAAG		RSHGEVPEVS
IYSVIFKCLE		PDGLYKFTLY		AVDTRGRHSE		LSTVTLRTAC		PLVDDNKAEE
IADKIYNLYN		GYTSGKEQQM		AYNTLMEVSA		SMLFRVQHHY		NSHYEKFGDF
VWRSEDELGP		RKAHLILRRL		ERVSSHCSSL		LRSAYIQSRV		ETVPYLFCRS
EEVRPAGMVW		YSILKDTKIT		CEEKMVSMAR		NTYGESKGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ni T., Harlos K., Gilbert R. (2016). Structure of astrotactin-2: a conserved vertebrate-specific and perforin-like membrane protein involved in neuronal development. Open Biol.: —. DOI:10.1098/RSOB.160053

Див. також

• Хромосома 9