GAK

GAK
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C57, 4C58, 4C59, 4O38, 4Y8D
Ідентифікатори
Символи	GAK, D130045N16Rik, DNAJ26, DNAJC26, cyclin G associated kinase
Зовнішні ІД	OMIM: 602052 MGI: 2442153 HomoloGene: 3846 GeneCards: GAK
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Паркінсона
Реагує на сполуку
SB-203580
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein serine/threonine kinase activity • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • kinase activity • cyclin binding • chaperone binding • clathrin binding Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • везикула • міжклітинні контакти • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • focal adhesion • гіалоплазма • синапс • presynapse Біологічний процес • protein phosphorylation • клітинний цикл • negative regulation of neuron projection development • Golgi organization • фосфорилювання • clathrin-dependent endocytosis • clathrin coat disassembly • Golgi to lysosome transport • endoplasmic reticulum organization • synaptic vesicle uncoating • chaperone cofactor-dependent protein refolding • membrane organization • clathrin-coated pit assembly • рецептор-опосередкований ендоцитоз • protein localization to plasma membrane • protein localization to Golgi apparatus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2580	231580
Ensembl	ENSG00000178950	ENSMUSG00000062234
UniProt	O14976	Q99KY4
RefSeq (мРНК)	NM_001286833 NM_005255 NM_001318134	NM_001282051 NM_001282052 NM_153569 NM_001359922 NM_001359923 NM_001359924
RefSeq (білок)	NP_001305063 NP_005246	NP_001268980 NP_001268981 NP_705797 NP_001346851 NP_001346852 NP_001346853
Локус (UCSC)	Хр. 4: 0.85 – 0.93 Mb	Хр. 5: 108.72 – 108.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GAK (англ. Cyclin G associated kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 311 амінокислот, а молекулярна маса — 143 191.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLLQSALDF		LAGPGSLGGA		SGRDQSDFVG		QTVELGELRL		RVRRVLAEGG
FAFVYEAQDV		GSGREYALKR		LLSNEEEKNR		AIIQEVCFMK		KLSGHPNIVQ
FCSAASIGKE		ESDTGQAEFL		LLTELCKGQL		VEFLKKMESR		GPLSCDTVLK
IFYQTCRAVQ		HMHRQKPPII		HRDLKVENLL		LSNQGTIKLC		DFGSATTISH
YPDYSWSAQR		RALVEEEITR		NTTPMYRTPE		IIDLYSNFPI		GEKQDIWALG
CILYLLCFRQ		HPFEDGAKLR		IVNGKYSIPP		HDTQYTVFHS		LIRAMLQVNP
EERLSIAEVV		HQLQEIAAAR		NVNPKSPITE		LLEQNGGYGS		ATLSRGPPPP
VGPAGSGYSG		GLALAEYDQP		YGGFLDILRG		GTERLFTNLK		DTSSKVIQSV
ANYAKGDLDI		SYITSRIAVM		SFPAEGVESA		LKNNIEDVRL		FLDSKHPGHY
AVYNLSPRTY		RPSRFHNRVS		ECGWAARRAP		HLHTLYNICR		NMHAWLRQDH
KNVCVVHCMD		GRAASAVAVC		SFLCFCRLFS		TAEAAVYMFS		MKRCPPGIWP
SHKRYIEYMC		DMVAEEPITP		HSKPILVRAV		VMTPVPLFSK		QRSGCRPFCE
VYVGDERVAS		TSQEYDKMRD		FKIEDGKAVI		PLGVTVQGDV		LIVIYHARST
LGGRLQAKMA		SMKMFQIQFH		TGFVPRNATT		VKFAKYDLDA		CDIQEKYPDL
FQVNLEVEVE		PRDRPSREAP		PWENSSMRGL		NPKILFSSRE		EQQDILSKFG
KPELPRQPGS		TAQYDAGAGS		PEAEPTDSDS		PPSSSADASR		FLHTLDWQEE
KEAETGAENA		SSKESESALM		EDRDESEVSD		EGGSPISSEG		QEPRADPEPP
GLAAGLVQQD		LVFEVETPAV		LPEPVPQEDG		VDLLGLHSEV		GAGPAVPPQA
CKAPSSNTDL		LSCLLGPPEA		ASQGPPEDLL		SEDPLLLASP		APPLSVQSTP
RGGPPAAADP		FGPLLPSSGN		NSQPCSNPDL		FGEFLNSDSV		TVPPSFPSAH
SAPPPSCSAD		FLHLGDLPGE		PSKMTASSSN		PDLLGGWAAW		TETAASAVAP
TPATEGPLFS		PGGQPAPCGS		QASWTKSQNP		DPFADLGDLS		SGLQGSPAGF
PPGGFIPKTA		TTPKGSSSWQ		TSRPPAQGAS		WPPQAKPPPK		ACTQPRPNYA
SNFSVIGARE		ERGVRAPSFA		QKPKVSENDF		EDLLSNQGFS		SRSDKKGPKT
IAEMRKQDLA		KDTDPLKLKL		LDWIEGKERN		IRALLSTLHT		VLWDGESRWT
PVGMADLVAP		EQVKKHYRRA		VLAVHPDKAA		GQPYEQHAKM		IFMELNDAWS
EFENQGSRPL		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі як клітинний цикл. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, клітинних контактах, апараті гольджі.

Література

• Kimura S.H., Tsuruga H., Yabuta N., Endo Y., Nojima H. (1997). Structure, expression, and chromosomal localization of human GAK. Genomics. 44: 179—187. PMID 9299234 DOI:10.1006/geno.1997.4873
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Greener T., Zhao X., Nojima H., Eisenberg E., Greene L.E. (2000). Role of cyclin G-associated kinase in uncoating clathrin-coated vesicles from non-neuronal cells. J. Biol. Chem. 275: 1365—1370. PMID 10625686 DOI:10.1074/jbc.275.2.1365

Див. також

• Хромосома 4