SMC1B

SMC1B
Ідентифікатори
Символи	SMC1B, SMC1BETA, SMC1L2, structural maintenance of chromosomes 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 608685 MGI: 2154049 HomoloGene: 13786 GeneCards: SMC1B
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ATP binding Клітинна компонента • lateral element • condensed nuclear chromosome • synaptonemal complex • центромера • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • GO:0034991 meiotic cohesin complex • гіалоплазма Біологічний процес • клітинний цикл • GO:0007126 мейоз • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • sister chromatid cohesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27127	140557
Ensembl	ENSG00000077935	ENSMUSG00000022432
UniProt	Q8NDV3	Q920F6
RefSeq (мРНК)	NM_001291501 NM_148674	NM_080470
RefSeq (білок)	NP_001278430 NP_683515	NP_536718
Локус (UCSC)	Хр. 22: 45.34 – 45.41 Mb	Хр. 15: 84.95 – 85.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMC1B (англ. Structural maintenance of chromosomes 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 235 амінокислот, а молекулярна маса — 143 908.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHLELLLVE		NFKSWRGRQV		IGPFRRFTCI		IGPNGSGKSN		VMDALSFVMG
EKIANLRVKN		IQELIHGAHI		GKPISSSASV		KIIYVEESGE		EKTFARIIRG
GCSEFRFNDN		LVSRSVYIAE		LEKIGIIVKA		QNCLVFQGTV		ESISVKKPKE
RTQFFEEIST		SGELIGEYEE		KKRKLQKAEE		DAQFNFNKKK		NIAAERRQAK
LEKEEAERYQ		SLLEELKMNK		IQLQLFQLYH		NEKKIHLLNT		KLEHVNRDLS
VKRESLSHHE		NIVKARKKEH		GMLTRQLQQT		EKELKSVETL		LNQKRPQYIK
AKENTSHHLK		KLDVAKKSIK		DSEKQCSKQE		DDIKALETEL		ADLDAAWRSF
EKQIEEEILH		KKRDIELEAS		QLDRYKELKE		QVRKKVATMT		QQLEKLQWEQ
KTDEERLAFE		KRRHGEVQGN		LKQIKEQIED		HKKRIEKLEE		YTKTCMDCLK
EKKQQEETLV		DEIEKTKSRM		SEFNEELNLI		RSELQNAGID		THEGKRQQKR
AEVLEHLKRL		YPDSVFGRLF		DLCHPIHKKY		QLAVTKVFGR		FITAIVVASE
KVAKDCIRFL		KEERAEPETF		LALDYLDIKP		INERLRELKG		CKMVIDVIKT
QFPQLKKVIQ		FVCGNGLVCE		TMEEARHIAL		SGPERQKTVA		LDGTLFLKSG
VISGGSSDLK		YKARCWDEKE		LKNLRDRRSQ		KIQELKGLMK		TLRKETDLKQ
IQTLIQGTQT		RLKYSQNELE		MIKKKHLVAF		YQEQSQLQSE		LLNIESQCIM
LSEGIKERQR		RIKEFQEKID		KVEDDIFQHF		CEEIGVENIR		EFENKHVKRQ
QEIDQKRYFY		KKMLTRLNVQ		LEYSRSHLKK		KLNKINTLKE		TIQKGSEDID
HLKKAEENCL		QTVNELMAKQ		QQLKDIRVTQ		NSSAEKVQTQ		IEEERKKFLA
VDREVGKLQK		EVVSIQTSLE		QKRLEKHNLL		LDCKVQDIEI		ILLSGSLDDI
IEVEMGTEAE		STQATIDIYE		KEEAFEIDYS		SLKEDLKALQ		SDQEIEAHLR
LLLQQVASQE		DILLKTAAPN		LRALENLKTV		RDKFQESTDA		FEASRKEARL
CRQEFEQVKK		RRYDLFTQCF		EHVSISIDQI		YKKLCRNNSA		QAFLSPENPE
EPYLEGISYN		CVAPGKRFMP		MDNLSGGEKC		VAALALLFAV		HSFRPAPFFV
LDEVDAALDN		TNIGKVSSYI		KEQTQDQFQM		IVISLKEEFY		SRADALIGIY
PEYDDCMFSR		VLTLDLSQYP		DTEGQESSKR		HGESR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

• Cobbe N., Heck M.M.S. (2004). The evolution of SMC proteins: phylogenetic analysis and structural implications. Mol. Biol. Evol. 21: 332—347. PMID 14660695 DOI:10.1093/molbev/msh023
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22