USP20

USP20
Ідентифікатори
Символи	USP20, LSFR3A, VDU2, hVDU2, ubiquitin specific peptidase 20
Зовнішні ІД	OMIM: 615143 MGI: 1921520 HomoloGene: 4861 GeneCards: USP20
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • G protein-coupled receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • центр організації мікротрубочок • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • гіалоплазма Біологічний процес • ендоцитоз • protein K48-linked deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway • протеоліз • protein K63-linked deubiquitination • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10868	74270
Ensembl	ENSG00000136878	ENSMUSG00000026854
UniProt	Q9Y2K6	Q8C6M1
RefSeq (мРНК)	NM_001008563 NM_001110303 NM_006676	NM_028846
RefSeq (білок)	NP_001008563 NP_001103773 NP_006667	NP_083122
Локус (UCSC)	Хр. 9: 129.83 – 129.88 Mb	Хр. 2: 30.87 – 30.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP20 (англ. Ubiquitin specific peptidase 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 102 003.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDSRDLCPH		LDSIGEVTKE		DLLLKSKGTC		QSCGVTGPNL		WACLQVACPY
VGCGESFADH		STIHAQAKKH		NLTVNLTTFR		LWCYACEKEV		FLEQRLAAPL
LGSSSKFSEQ		DSPPPSHPLK		AVPIAVADEG		ESESEDDDLK		PRGLTGMKNL
GNSCYMNAAL		QALSNCPPLT		QFFLECGGLV		RTDKKPALCK		SYQKLVSEVW
HKKRPSYVVP		TSLSHGIKLV		NPMFRGYAQQ		DTQEFLRCLM		DQLHEELKEP
VVATVALTEA		RDSDSSDTDE		KREGDRSPSE		DEFLSCDSSS		DRGEGDGQGR
GGGSSQAETE		LLIPDEAGRA		ISEKERMKDR		KFSWGQQRTN		SEQVDEDADV
DTAMAALDDQ		PAEAQPPSPR		SSSPCRTPEP		DNDAHLRSSS		RPCSPVHHHE
GHAKLSSSPP		RASPVRMAPS		YVLKKAQVLS		AGSRRRKEQR		YRSVISDIFD
GSILSLVQCL		TCDRVSTTVE		TFQDLSLPIP		GKEDLAKLHS		AIYQNVPAKP
GACGDSYAAQ		GWLAFIVEYI		RRFVVSCTPS		WFWGPVVTLE		DCLAAFFAAD
ELKGDNMYSC		ERCKKLRNGV		KYCKVLRLPE		ILCIHLKRFR		HEVMYSFKIN
SHVSFPLEGL		DLRPFLAKEC		TSQITTYDLL		SVICHHGTAG		SGHYIAYCQN
VINGQWYEFD		DQYVTEVHET		VVQNAEGYVL		FYRKSSEEAM		RERQQVVSLA
AMREPSLLRF		YVSREWLNKF		NTFAEPGPIT		NQTFLCSHGG		IPPHKYHYID
DLVVILPQNV		WEHLYNRFGG		GPAVNHLYVC		SICQVEIEAL		AKRRRIEIDT
FIKLNKAFQA		EESPGVIYCI		SMQWFREWEA		FVKGKDNEPP		GPIDNSRIAQ
VKGSGHVQLK		QGADYGQISE		ETWTYLNSLY		GGGPEIAIRQ		SVAQPLGPEN
LHGEQKIEAE		TRAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gilley J., Fried M. (1999). Extensive gene order differences within regions of conserved synteny between the Fugu and human genomes: implications for chromosomal evolution and the cloning of disease genes. Hum. Mol. Genet. 8: 1313—1320. PMID 10369878 DOI:10.1093/hmg/8.7.1313
• Li Z., Wang D., Messing E.M., Wu G. (2005). VHL protein-interacting deubiquitinating enzyme 2 deubiquitinates and stabilizes HIF-1alpha. EMBO Rep. 6: 373—378. PMID 15776016 DOI:10.1038/sj.embor.7400377
• Berthouze M., Venkataramanan V., Li Y., Shenoy S.K. (2009). The deubiquitinases USP33 and USP20 coordinate beta2 adrenergic receptor recycling and resensitization. EMBO J. 28: 1684—1696. PMID 19424180 DOI:10.1038/emboj.2009.128

Див. також

• Хромосома 9