HIST1H1E

HIST1H1E
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3TZD, 5JJZ
Ідентифікатори
Символи	H1-4, histone cluster 1, H1e, H1.4, H1E, H1F4, H1s-4, dJ221C16.5, histone cluster 1 H1 family member e, RMNS, HIST1H1E, H1.4 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142220 MGI: 1931527 HomoloGene: 130534 GeneCards: H1-4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • chromatin DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleotide binding • double-stranded DNA binding • calcium ion binding • ATP binding • GTP binding • AMP binding • dATP binding • ADP binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • Нуклеосома • екзосома • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K4 trimethylation • nucleosome assembly • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • histone H3-K27 trimethylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3008	50709
Ensembl	ENSG00000168298	ENSMUSG00000051627
UniProt	P10412	P43274
RefSeq (мРНК)	NM_005321	NM_015787
RefSeq (білок)	NP_005312 NP_005312.1	NP_056602
Локус (UCSC)	Хр. 6: 26.16 – 26.16 Mb	Хр. 13: 23.8 – 23.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HIST1H1E (англ. Histone cluster 1 H1 family member e) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 21 865.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSETAPAAPA		APAPAEKTPV		KKKARKSAGA		AKRKASGPPV		SELITKAVAA
SKERSGVSLA		ALKKALAAAG		YDVEKNNSRI		KLGLKSLVSK		GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK		AASGEAKPKA		KKAGAAKAKK		PAGAAKKPKK		ATGAATPKKS
AKKTPKKAKK		PAAAAGAKKA		KSPKKAKAAK		PKKAPKSPAK		AKAVKPKAAK
PKTAKPKAAK		PKKAAAKKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
• Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
• Ohe Y., Hayashi H., Iwai K. (1986). Human spleen histone H1. Isolation and amino acid sequence of a main variant, H1b. J. Biochem. 100: 359—368. PMID 3782055

Див. також

• Хромосома 6