CDC42SE1

CDC42SE1
Ідентифікатори
Символи	CDC42SE1, SCIP1, SPEC1, CDC42 small effector 1
Зовнішні ІД	MGI: 1889510 HomoloGene: 23209 GeneCards: CDC42SE1
Онтологія гена Молекулярна функція • GTPase inhibitor activity • structural molecule activity Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of cell shape • Фагоцитоз • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • regulation of Rho protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56882	57912
Ensembl	ENSG00000197622	ENSMUSG00000046722
UniProt	Q9NRR8	Q8BHL7
RefSeq (мРНК)	NM_020239 NM_001038707	NM_001038708 NM_172395
RefSeq (білок)	NP_001033796 NP_064624	NP_001033797 NP_765983
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.05 – 151.07 Mb	Хр. 3: 95.14 – 95.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDC42SE1 (англ. CDC42 small effector 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 79 амінокислот, а молекулярна маса — 8 925.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEFWHKLGC		CVVEKPQPKK		KRRRIDRTMI		GEPMNFVHLT		HIGSGEMGAG
DGLAMTGAVQ		EQMRSKGNRD		RPWSNSRGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

W: Триптофан

Задіяний у таких біологічних процесах, як пдтримання форми клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• Pirone D.M., Fukuhara S., Gutkind J.S., Burbelo P.D. (2000). SPECs, small binding proteins for Cdc42. J. Biol. Chem. 275: 22650—22656. PMID 10816584 DOI:10.1074/jbc.M002832200
• Pirone D.M., Oberst M.D., Stylianou D., Burbelo P.D. (2001). The genomic structure of the human SPEC1 gene reveals complex splicing and close promoter proximity to the AF1q translocation gene. Gene. 273: 295—303. PMID 11595176 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00561-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ching K.H., Kisailus A.E., Burbelo P.D. (2005). The role of SPECs, small Cdc42-binding proteins, in F-actin accumulation at the immunological synapse. J. Biol. Chem. 280: 23660—23667. PMID 15840583 DOI:10.1074/jbc.M500128200
• Ching K.H., Kisailus A.E., Burbelo P.D. (2007). Biochemical characterization of distinct regions of SPEC molecules and their role in phagocytosis. Exp. Cell Res. 313: 10—21. PMID 17045588 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.09.011

Див. також

• Хромосома 1