Гістон H1b

Гістон H1b
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RHI
Ідентифікатори
Символи	H1-5, H1, H1.5, H1B, H1F5, H1s-3, histone cluster 1, H1b, histone cluster 1 H1 family member b, HIST1H1B, H1.5 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142711 HomoloGene: 136789 GeneCards: H1-5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • histone deacetylase binding • chromatin DNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • nucleosomal DNA binding Клітинна компонента • Нуклеосома • екзосома • хромосома • клітинне ядро Біологічний процес • establishment of protein localization to chromatin • nucleosome assembly • protein stabilization • positive regulation of cell growth • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of histone H3-K9 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination • muscle organ development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3009	н/д
Ensembl	ENSG00000184357	н/д
UniProt	P16401	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005322	н/д
RefSeq (білок)	NP_005313	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 27.87 – 27.87 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Гістон H1b (англ. Histone cluster 1 H1 family member b) – білок, який кодується геном HIST1H1B, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 226 амінокислот, а молекулярна маса — 22 580.

Представник родини білків гістонів H1.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSETAPAETA		TPAPVEKSPA		KKKATKKAAG		AGAAKRKATG		PPVSELITKA
VAASKERNGL		SLAALKKALA		AGGYDVEKNN		SRIKLGLKSL		VSKGTLVQTK
GTGASGSFKL		NKKAASGEAK		PKAKKAGAAK		AKKPAGATPK		KAKKAAGAKK
AVKKTPKKAK		KPAAAGVKKV		AKSPKKAKAA		AKPKKATKSP		AKPKAVKPKA
AKPKAAKPKA		AKPKAAKAKK		AAAKKK

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Albig W., Meergans T., Doenecke D. (1997). Characterization of the H1.5 gene completes the set of human H1 subtype genes. Gene. 184: 141—148. PMID 9031620 DOI:10.1016/S0378-1119(96)00582-3
• Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
• Parseghian M.H., Newcomb R.L., Hamkalo B.A. (2001). Distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin II: distribution in human adult fibroblasts. J. Cell. Biochem. 83: 643—659. PMID 11746507 DOI:10.1002/jcb.1224
• Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200

Див. також

• Хромосома 6