Кодзі Кобаясі, молодий пілот, що працює на рибно-продуктовій фабриці в Осаці, зазнає трощі на невеликому скелястому острівці в океані. Йому на допомогу прилітає його колега — Сьоїті Цукіока. Він знаходить Кодзі живим та здоровим. Пілоти розуміють, що вони не самі на острові, і бачать чомусь живого у, що б'ється з величезним колючкуватим динозавром.
Повернувшись в Осаку, пілоти постають перед органами влади, де ті встановлюють, що монстр, з яким бився Ґодзілла — доісторичний ящір-ангірозавр Ангірус. Учений Ямана не знає жодного способу знову вбити Ґодзіллу. Руйнівник кисню і його винахідник — доктор Серідзава, були знищені при перемозі над Ґодзіллою роком раніше. Ямана пропонує відволікти Ґодзіллу чимдалі від берега за допомогою світлових бомб.
За допомогою авіації Ґодзіллу дійсно вдається відігнати. Між тим через план злочинців спалахує величезна будівля, і Ґодзілла повертається в Осаку. До міста припливає Ангірус і між чудовиськами знову починається сутичка. Ґодзілла й Ангірус руйнують частину міста, в тому числі і замок в Осаці. Врешті-решт Ґодзіллі вдається перегризти шию супротивникові.
Цукіока починає пошуки Ґодзілли та виявляє його, коли той пливе до крижаного острова.
Кобаясі та авіація намагаються знищити Ґодзіллу, і навіть бомбардують його. Проте ящір залишається живий, і вбиває Кодзі. Цукіока пропонує поховати Ґодзіллу під сніговою лавиною. Після довгого обстрілу Ґодзілла назавжди стає похованим під крижинами.