GPD1L

GPD1L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PLA
Ідентифікатори
Символи	GPD1L, GPD1-L, glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like, glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like
Зовнішні ІД	OMIM: 611778 MGI: 1289257 HomoloGene: 56097 GeneCards: GPD1L
Пов'язані генетичні захворювання
Brugada syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • sodium channel regulator activity • protein homodimerization activity • transmembrane transporter binding • NAD binding • oxidoreductase activity • glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD+ activity] Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • glycerol-3-phosphate dehydrogenase complex • екзосома Біологічний процес • phosphatidic acid biosynthetic process • regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization • negative regulation of protein kinase C signaling • glycerol-3-phosphate catabolic process • ventricular cardiac muscle cell action potential • glycerol-3-phosphate metabolic process • NAD metabolic process • регуляція серцевого ритму • NADH metabolic process • regulation of sodium ion transmembrane transporter activity • positive regulation of protein localization to cell surface • GO:0061423 positive regulation of sodium ion transport • negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation • carbohydrate metabolic process • потенціал дії • NADH oxidation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23171	333433
Ensembl	ENSG00000152642	ENSMUSG00000050627
UniProt	Q8N335	Q3ULJ0
RefSeq (мРНК)	NM_015141	NM_175380
RefSeq (білок)	NP_055956	NP_780589
Локус (UCSC)	Хр. 3: 32.11 – 32.17 Mb	Хр. 9: 114.73 – 114.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPD1L (англ. Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 419.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAPLKVCI		VGSGNWGSAV		AKIIGNNVKK		LQKFASTVKM		WVFEETVNGR
KLTDIINNDH		ENVKYLPGHK		LPENVVAMSN		LSEAVQDADL		LVFVIPHQFI
HRICDEITGR		VPKKALGITL		IKGIDEGPEG		LKLISDIIRE		KMGIDISVLM
GANIANEVAA		EKFCETTIGS		KVMENGLLFK		ELLQTPNFRI		TVVDDADTVE
LCGALKNIVA		VGAGFCDGLR		CGDNTKAAVI		RLGLMEMIAF		ARIFCKGQVS
TATFLESCGV		ADLITTCYGG		RNRRVAEAFA		RTGKTIEELE		KEMLNGQKLQ
GPQTSAEVYR		ILKQKGLLDK		FPLFTAVYQI		CYESRPVQEM		LSCLQSHPEH
T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Valdivia C.R., Ueda K., Ackerman M.J., Makielski J.C. (2009). GPD1L links redox state to cardiac excitability by PKC-dependent phosphorylation of the sodium channel SCN5A. Am. J. Physiol. 297: H1446—H1452. PMID 19666841 DOI:10.1152/ajpheart.00513.2009

Див. також

• Хромосома 3