LGR5

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
LGR5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LGR5, FEX, GPR49, GPR67, GRP49, HG38, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5
Зовнішні ІД OMIM: 606667 MGI: 1341817 HomoloGene: 20807 GeneCards: LGR5
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001277226
NM_001277227
NM_003667
NM_010195
RefSeq (білок)
NP_001264155
NP_001264156
NP_003658
NP_034325
Локус (UCSC) Хр. 12: 71.44 – 71.59 Mb Хр. 10: 115.29 – 115.42 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LGR5 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 907 амінокислот, а молекулярна маса — 99 998[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRV
DCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGN
ALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHI
SYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHH
IPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFP
TAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA
FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQ
LPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSL
RSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKL
TGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDN
SSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKP
CEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA
AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASES
SVFLLTLAALERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPL
LGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCN
LDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEV
IKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLM
SINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS
VAFVPCL

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.

Література

  • Hsu S.Y., Liang S.-G., Hsueh A.J.W. (1998). Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine-rich repeats and a G protein-coupled, seven-transmembrane region. Mol. Endocrinol. 12: 1830—1845. PMID 9849958 DOI:10.1210/mend.12.12.0211
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Becker L., Huang Q., Mashimo H. (2008). Immunostaining of Lgr5, an intestinal stem cell marker, in normal and premalignant human gastrointestinal tissue. ScientificWorldJournal. 8: 1168—1176. PMID 19030762 DOI:10.1100/tsw.2008.148
  • Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108
  • Snyder J.C., Rochelle L.K., Lyerly H.K., Caron M.G., Barak L.S. (2013). Constitutive Internalization of the Leucine-rich G Protein-coupled Receptor-5 (LGR5) to the Trans-Golgi Network. J. Biol. Chem. 288: 10286—10297. PMID 23439653 DOI:10.1074/jbc.M112.447540
  • Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4504 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, O75473 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також