LGR5

LGR5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BSR, 4BSS, 4BST, 4BSU, 4KNG, 4UFR, 4UFS
Ідентифікатори
Символи	LGR5, FEX, GPR49, GPR67, GRP49, HG38, leucine-rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606667 MGI: 1341817 HomoloGene: 20807 GeneCards: LGR5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • signal transducer activity • protein-hormone receptor activity • G protein-coupled peptide receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • integral component of plasma membrane • trans-Golgi network membrane • мембрана Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • hair follicle development • inner ear development • G protein-coupled receptor signaling pathway • epithelial cell proliferation involved in renal tubule morphogenesis • regulation of cell population proliferation • oocyte differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • activation of adenylate cyclase activity • hormone-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8549	14160
Ensembl	ENSG00000139292	ENSMUSG00000020140
UniProt	O75473	Q9Z1P4
RefSeq (мРНК)	NM_001277226 NM_001277227 NM_003667	NM_010195
RefSeq (білок)	NP_001264155 NP_001264156 NP_003658	NP_034325
Локус (UCSC)	Хр. 12: 71.44 – 71.59 Mb	Хр. 10: 115.29 – 115.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LGR5 (англ. Leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 907 амінокислот, а молекулярна маса — 99 998.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTSRLGVLL		SLPVLLQLAT		GGSSPRSGVL		LRGCPTHCHC		EPDGRMLLRV
DCSDLGLSEL		PSNLSVFTSY		LDLSMNNISQ		LLPNPLPSLR		FLEELRLAGN
ALTYIPKGAF		TGLYSLKVLM		LQNNQLRHVP		TEALQNLRSL		QSLRLDANHI
SYVPPSCFSG		LHSLRHLWLD		DNALTEIPVQ		AFRSLSALQA		MTLALNKIHH
IPDYAFGNLS		SLVVLHLHNN		RIHSLGKKCF		DGLHSLETLD		LNYNNLDEFP
TAIRTLSNLK		ELGFHSNNIR		SIPEKAFVGN		PSLITIHFYD		NPIQFVGRSA
FQHLPELRTL		TLNGASQITE		FPDLTGTANL		ESLTLTGAQI		SSLPQTVCNQ
LPNLQVLDLS		YNLLEDLPSF		SVCQKLQKID		LRHNEIYEIK		VDTFQQLLSL
RSLNLAWNKI		AIIHPNAFST		LPSLIKLDLS		SNLLSSFPIT		GLHGLTHLKL
TGNHALQSLI		SSENFPELKV		IEMPYAYQCC		AFGVCENAYK		ISNQWNKGDN
SSMDDLHKKD		AGMFQAQDER		DLEDFLLDFE		EDLKALHSVQ		CSPSPGPFKP
CEHLLDGWLI		RIGVWTIAVL		ALTCNALVTS		TVFRSPLYIS		PIKLLIGVIA
AVNMLTGVSS		AVLAGVDAFT		FGSFARHGAW		WENGVGCHVI		GFLSIFASES
SVFLLTLAAL		ERGFSVKYSA		KFETKAPFSS		LKVIILLCAL		LALTMAAVPL
LGGSKYGASP		LCLPLPFGEP		STMGYMVALI		LLNSLCFLMM		TIAYTKLYCN
LDKGDLENIW		DCSMVKHIAL		LLFTNCILNC		PVAFLSFSSL		INLTFISPEV
IKFILLVVVP		LPACLNPLLY		ILFNPHFKED		LVSLRKQTYV		WTRSKHPSLM
SINSDDVEKQ		SCDSTQALVT		FTSSSITYDL		PPSSVPSPAY		PVTESCHLSS
VAFVPCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Hsu S.Y., Liang S.-G., Hsueh A.J.W. (1998). Characterization of two LGR genes homologous to gonadotropin and thyrotropin receptors with extracellular leucine-rich repeats and a G protein-coupled, seven-transmembrane region. Mol. Endocrinol. 12: 1830—1845. PMID 9849958 DOI:10.1210/mend.12.12.0211
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Becker L., Huang Q., Mashimo H. (2008). Immunostaining of Lgr5, an intestinal stem cell marker, in normal and premalignant human gastrointestinal tissue. ScientificWorldJournal. 8: 1168—1176. PMID 19030762 DOI:10.1100/tsw.2008.148
• Carmon K.S., Gong X., Lin Q., Thomas A., Liu Q. (2011). R-spondins function as ligands of the orphan receptors LGR4 and LGR5 to regulate Wnt/beta-catenin signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 11452—11457. PMID 21693646 DOI:10.1073/pnas.1106083108
• Snyder J.C., Rochelle L.K., Lyerly H.K., Caron M.G., Barak L.S. (2013). Constitutive Internalization of the Leucine-rich G Protein-coupled Receptor-5 (LGR5) to the Trans-Golgi Network. J. Biol. Chem. 288: 10286—10297. PMID 23439653 DOI:10.1074/jbc.M112.447540
• Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113

Див. також

• Хромосома 12