NAGA

NAGA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4DO5, 3H53, 3IGU, 4DO4, 4DO6, 3H54, 3H55
Ідентифікатори
Символи	NAGA, D22S674, GALB, alpha-N-acetylgalactosaminidase
Зовнішні ІД	OMIM: 104170 MGI: 1261422 HomoloGene: 221 GeneCards: NAGA
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds • alpha-N-acetylgalactosaminidase activity • hydrolase activity • protein homodimerization activity • alpha-galactosidase activity • каталітична активність • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds Клітинна компонента • цитоплазма • лізосома • екзосома Біологічний процес • carbohydrate catabolic process • обмін речовин • glycoside catabolic process • glycolipid catabolic process • oligosaccharide metabolic process • glycosylceramide catabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4668	17939
Ensembl	ENSG00000198951	ENSMUSG00000022453
UniProt	P17050	Q9QWR8
RefSeq (мРНК)	NM_000262 NM_001362848 NM_001362850	NM_008669 NM_001355546
RefSeq (білок)	NP_000253 NP_001349777 NP_001349779 NP_000253.1	NP_032695 NP_001342475
Локус (UCSC)	Хр. 22: 42.06 – 42.07 Mb	Хр. 15: 82.21 – 82.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NAGA (англ. Alpha-N-acetylgalactosaminidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLKTVLLLG		HVAQVLMLDN		GLLQTPPMGW		LAWERFRCNI		NCDEDPKNCI
SEQLFMEMAD		RMAQDGWRDM		GYTYLNIDDC		WIGGRDASGR		LMPDPKRFPH
GIPFLADYVH		SLGLKLGIYA		DMGNFTCMGY		PGTTLDKVVQ		DAQTFAEWKV
DMLKLDGCFS		TPEERAQGYP		KMAAALNATG		RPIAFSCSWP		AYEGGLPPRV
NYSLLADICN		LWRNYDDIQD		SWWSVLSILN		WFVEHQDILQ		PVAGPGHWND
PDMLLIGNFG		LSLEQSRAQM		ALWTVLAAPL		LMSTDLRTIS		AQNMDILQNP
LMIKINQDPL		GIQGRRIHKE		KSLIEVYMRP		LSNKASALVF		FSCRTDMPYR
YHSSLGQLNF		TGSVIYEAQD		VYSGDIISGL		RDETNFTVII		NPSGVVMWYL
YPIKNLEMSQ		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз, фосфопротеїнів. Локалізований у лізосомі.

Література

• Wang A.M., Desnick R.J. (1991). Structural organization and complete sequence of the human alpha-N-acetylgalactosaminidase gene: homology with the alpha-galactosidase A gene provides evidence for evolution from a common ancestral gene. Genomics. 10: 133—142. PMID 1646157 DOI:10.1016/0888-7543(91)90493-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Warner T.G., Louie A., Potier M. (1990). Photolabeling of the alpha-neuraminidase/beta-galactosidase complex from human placenta with a photoreactive neuraminidase inhibitor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 173: 13—19. PMID 2256909 DOI:10.1016/S0006-291X(05)81014-9
• Clark N.E., Garman S.C. (2009). The 1.9 A structure of human alpha-N-acetylgalactosaminidase: the molecular basis of Schindler and Kanzaki diseases. J. Mol. Biol. 393: 435—447. PMID 19683538 DOI:10.1016/j.jmb.2009.08.021
• Wang A.M., Schindler D., Desnick R.J. (1990). Schindler disease: the molecular lesion in the alpha-N-acetylgalactosaminidase gene that causes an infantile neuroaxonal dystrophy. J. Clin. Invest. 86: 1752—1756. PMID 2243144 DOI:10.1172/JCI114901
• Wang A.M., Kanzaki T., Desnick R.J. (1994). The molecular lesion in the alpha-N-acetylgalactosaminidase gene that causes angiokeratoma corporis diffusum with glycopeptiduria. J. Clin. Invest. 94: 839—845. PMID 8040340 DOI:10.1172/JCI117404

Див. також

• Хромосома 22