PARD6A

PARD6A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WMH
Ідентифікатори
Символи	PARD6A, PAR-6A, PAR6, PAR6C, PAR6alpha, TAX40, TIP-40, par-6 family cell polarity regulator alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 607484 MGI: 1927223 HomoloGene: 9661 GeneCards: PARD6A
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • GTP-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase C binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cell projection • мембрана • bicellular tight junction • ruffle • клітинна мембрана • cell cortex • клітинне ядро • цитоплазма • центросома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • міжклітинні контакти • centriolar satellite • GO:0009327 protein-containing complex • apical plasma membrane Біологічний процес • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • поділ клітини • cell-cell junction maintenance • bicellular tight junction assembly • клітинний цикл • GO:0022415 viral process • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of protein localization to centrosome • centrosome cycle • establishment or maintenance of cell polarity • regulation of cellular localization • positive regulation of protein secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50855	56513
Ensembl	ENSG00000102981	ENSMUSG00000005699
UniProt	Q9NPB6	Q9Z101
RefSeq (мРНК)	NM_001037281 NM_016948	NM_001047435 NM_001047436 NM_001286344 NM_001286345 NM_019695
RefSeq (білок)	NP_001032358 NP_058644	NP_001040900 NP_001040901 NP_001273273 NP_001273274 NP_062669
Локус (UCSC)	Хр. 16: 67.66 – 67.66 Mb	Хр. 8: 106.43 – 106.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PARD6A (англ. Par-6 family cell polarity regulator alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 37 388.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARPQRTPAR		SPDSIVEVKS		KFDAEFRRFA		LPRASVSGFQ		EFSRLLRAVH
QIPGLDVLLG		YTDAHGDLLP		LTNDDSLHRA		LASGPPPLRL		LVQKRAEADS
SGLAFASNSL		QRRKKGLLLR		PVAPLRTRPP		LLISLPQDFR		QVSSVIDVDL
LPETHRRVRL		HKHGSDRPLG		FYIRDGMSVR		VAPQGLERVP		GIFISRLVRG
GLAESTGLLA		VSDEILEVNG		IEVAGKTLDQ		VTDMMVANSH		NLIVTVKPAN
QRNNVVRGAS		GRLTGPPSAG		PGPAEPDSDD		DSSDLVIENR		QPPSSNGLSQ
GPPCWDLHPG		CRHPGTRSSL		PSLDDQEQAS		SGWGSRIRGD		GSGFSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах.

Література

• Qiu R.-G., Abo A., Martin G.S. (2000). A human homolog of the Caenorhabditis elegans polarity determinant Par-6 links Rac and Cdc42 to PKC-zeta signaling and cell transformation. Curr. Biol. 10: 697—707. PMID 10873802 DOI:10.1016/S0960-9822(00)00535-2
• Joberty G., Petersen C., Gao L., Macara I.G. (2000). The cell-polarity protein Par6 links Par3 and atypical protein kinase C to Cdc42. Nat. Cell Biol. 2: 531—539. PMID 10934474 DOI:10.1038/35019573
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rousset R., Fabre S., Desbois C., Bantignies F., Jalinot P. (1998). The C-terminus of the HTLV-1 Tax oncoprotein mediates interaction with the PDZ domain of cellular proteins. Oncogene. 16: 643—654. PMID 9482110 DOI:10.1038/sj.onc.1201567
• Hurd T.W., Gao L., Roh M.H., Macara I.G., Margolis B. (2003). Direct interaction of two polarity complexes implicated in epithelial tight junction assembly. Nat. Cell Biol. 5: 137—142. PMID 12545177 DOI:10.1038/ncb923
• Liu X.F., Ishida H., Raziuddin R., Miki T. (2004). Nucleotide exchange factor ECT2 interacts with the polarity protein complex Par6/Par3/protein kinase Czeta (PKCzeta) and regulates PKCzeta activity. Mol. Cell. Biol. 24: 6665—6675. PMID 15254234 DOI:10.1128/MCB.24.15.6665-6675.2004

Див. також

• Хромосома 16