PEX5

PEX5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FCH, 2C0L, 2C0M, 2J9Q, 2W84, 3R9A, 4BXU, 4KXK, 4KYO
Ідентифікатори
Символи	PEX5, peroxisomal biogenesis factor 5, RCDP5, PTS1R, PBD2B, PTS1-BP, PXR1, PBD2A
Зовнішні ІД	OMIM: 600414 MGI: 1098808 HomoloGene: 270 GeneCards: PEX5
Пов'язані генетичні захворювання
rhizomelic chondrodysplasia punctata type 5, Zellweger spectrum disorder, peroxisomal biogenesis disorder
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • small GTPase binding • protein N-terminus binding • peroxisome targeting sequence binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peroxisome matrix targeting signal-1 binding Клітинна компонента • цитоплазма • пероксисома • мембрана • peroxisomal matrix • внутрішньоклітинний • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • peroxisomal membrane • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • negative regulation of protein homotetramerization • protein import into peroxisome membrane • protein import into peroxisome matrix, docking • protein tetramerization • protein transport • protein targeting to peroxisome • protein import into peroxisome matrix, translocation • protein import into peroxisome matrix • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5830	19305
Ensembl	ENSG00000139197 ENSG00000288217	ENSMUSG00000005069
UniProt	P50542	O09012
RefSeq (мРНК)	NM_000319 NM_001131023 NM_001131024 NM_001131025 NM_001131026 NM_001300789 NM_001351124 NM_001351126 NM_001351127 NM_001351128 NM_001351130 NM_001351131 NM_001351132 NM_001351133 NM_001351134 NM_001351135 NM_001351136 NM_001351137 NM_001351138 NM_001351139 NM_001351140 NM_001374645 NM_001374646 NM_001374647 NM_001374648 NM_001374649	NM_001277330 NM_001277805 NM_008995 NM_175933 NM_001360570
RefSeq (білок)	NP_000310 NP_001124495 NP_001124496 NP_001124497 NP_001124498 NP_001287718 NP_001338053 NP_001338055 NP_001338056 NP_001338057 NP_001338059 NP_001338060 NP_001338061 NP_001338062 NP_001338063 NP_001338064 NP_001338065 NP_001338066 NP_001338067 NP_001338068 NP_001338069	NP_001264259 NP_001264734 NP_033021 NP_787947 NP_001347499
Локус (UCSC)	Хр. 12: 7.19 – 7.22 Mb	Хр. 6: 124.37 – 124.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PEX5 (англ. Peroxisomal biogenesis factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 70 865.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMRELVEAE		CGGANPLMKL		AGHFTQDKAL		RQEGLRPGPW		PPGAPASEAA
SKPLGVASED		ELVAEFLQDQ		NAPLVSRAPQ		TFKMDDLLAE		MQQIEQSNFR
QAPQRAPGVA		DLALSENWAQ		EFLAAGDAVD		VTQDYNETDW		SQEFISEVTD
PLSVSPARWA		EEYLEQSEEK		LWLGEPEGTA		TDRWYDEYHP		EEDLQHTASD
FVAKVDDPKL		ANSEFLKFVR		QIGEGQVSLE		SGAGSGRAQA		EQWAAEFIQQ
QGTSDAWVDQ		FTRPVNTSAL		DMEFERAKSA		IESDVDFWDK		LQAELEEMAK
RDAEAHPWLS		DYDDLTSATY		DKGYQFEEEN		PLRDHPQPFE		EGLRRLQEGD
LPNAVLLFEA		AVQQDPKHME		AWQYLGTTQA		ENEQELLAIS		ALRRCLELKP
DNQTALMALA		VSFTNESLQR		QACETLRDWL		RYTPAYAHLV		TPAEEGAGGA
GLGPSKRILG		SLLSDSLFLE		VKELFLAAVR		LDPTSIDPDV		QCGLGVLFNL
SGEYDKAVDC		FTAALSVRPN		DYLLWNKLGA		TLANGNQSEE		AVAAYRRALE
LQPGYIRSRY		NLGISCINLG		AHREAVEHFL		EALNMQRKSR		GPRGEGGAMS
ENIWSTLRLA		LSMLGQSDAY		GAADARDLST		LLTMFGLPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chang C.C., Warren D.S., Sacksteder K.A., Gould S.J. (1999). PEX12 interacts with PEX5 and PEX10 and acts downstream of receptor docking in peroxisomal matrix protein import. J. Cell Biol. 147: 761—774. PMID 10562279 DOI:10.1083/jcb.147.4.761
• Miyata N., Okumoto K., Mukai S., Noguchi M., Fujiki Y. (2012). AWP1/ZFAND6 functions in Pex5 export by interacting with cys-monoubiquitinated Pex5 and Pex6 AAA ATPase. Traffic. 13: 168—183. PMID 21980954 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01298.x
• Gatto G.J. Jr., Geisbrecht B.V., Gould S.J., Berg J.M. (2000). Peroxisomal targeting signal-1 recognition by the TPR domains of human PEX5. Nat. Struct. Biol. 7: 1091—1095. PMID 11101887 DOI:10.1038/81930

Див. також

• Хромосома 12