PODXL

PODXL
Ідентифікатори
Символи	PODXL, Gp200, PC, PCLP, PCLP-1, podocalyxin like, PODXL1, PDX, gp135
Зовнішні ІД	OMIM: 602632 HomoloGene: 136790 GeneCards: PODXL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell body • integral component of membrane • cell projection • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • Філоподія • ruffle • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Мікроворсинки • slit diaphragm • apical plasma membrane • membrane raft • екзосома • microvillus membrane • lamellipodium • міжклітинний простір • ядерце • центр організації мікротрубочок Біологічний процес • regulation of microvillus assembly • negative regulation of cell adhesion • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin • glomerular visceral epithelial cell development • negative regulation of cell-cell adhesion • positive regulation of cell migration • адгезія клітин • regulation of cell-cell adhesion • cell migration • leukocyte migration • epithelial tube formation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5420	н/д
Ensembl	ENSG00000128567	н/д
UniProt	O00592	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_005397 NM_001018111	н/д
RefSeq (білок)	NP_001018121 NP_005388	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 7: 131.5 – 131.56 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

PODXL (англ. Podocalyxin like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 558 амінокислот, а молекулярна маса — 58 635.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRCALALSAL		LLLLSTPPLL		PSSPSPSPSP		SQNATQTTTD		SSNKTAPTPA
SSVTIMATDT		AQQSTVPTSK		ANEILASVKA		TTLGVSSDSP		GTTTLAQQVS
GPVNTTVARG		GGSGNPTTTI		ESPKSTKSAD		TTTVATSTAT		AKPNTTSSQN
GAEDTTNSGG		KSSHSVTTDL		TSTKAEHLTT		PHPTSPLSPR		QPTSTHPVAT
PTSSGHDHLM		KISSSSSTVA		IPGYTFTSPG		MTTTLLETVF		HHVSQAGLEL
LTSGDLPTLA		SQSAGITASS		VISQRTQQTS		SQMPASSTAP		SSQETVQPTS
PATALRTPTL		PETMSSSPTA		ASTTHRYPKT		PSPTVAHESN		WAKCEDLETQ
TQSEKQLVLN		LTGNTLCAGG		ASDEKLISLI		CRAVKATFNP		AQDKCGIRLA
SVPGSQTVVV		KEITIHTKLP		AKDVYERLKD		KWDELKEAGV		SDMKLGDQGP
PEEAEDRFSM		PLIITIVCMA		SFLLLVAALY		GCCHQRLSQR		KDQQRLTEEL
QTVENGYHDN		PTLEVMETSS		EMQEKKVVSL		NGELGDSWIV		PLDNLTKDDL
DEEEDTHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schopperle W.M., Kershaw D.B., DeWolf W.C. (2003). Human embryonal carcinoma tumor antigen, Gp200/GCTM-2, is podocalyxin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 300: 285—290. PMID 12504081 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02844-9
• Sizemore S., Cicek M., Sizemore N., Ng K.P., Casey G. (2007). Podocalyxin increases the aggressive phenotype of breast and prostate cancer cells in vitro through its interaction with ezrin. Cancer Res. 67: 6183—6191. PMID 17616675 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-3575

Див. також

• Хромосома 7