SPARCL1

SPARCL1
Ідентифікатори
Символи	SPARCL1, MAST 9, MAST9, PIG33, SC1, SPARC like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606041 MGI: 108110 HomoloGene: 3438 GeneCards: SPARCL1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • collagen binding • extracellular matrix binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix • glutamatergic synapse Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:1903374 anatomical structure development • посттрансляційна модифікація • synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8404	13602
Ensembl	ENSG00000152583	ENSMUSG00000029309
UniProt	Q14515	P70663
RefSeq (мРНК)	NM_004684 NM_001128310 NM_001291976 NM_001291977	NM_010097 NM_001359014 NM_001359016
RefSeq (білок)	NP_001121782 NP_001278905 NP_001278906 NP_004675	NP_034227 NP_001345943 NP_001345945
Локус (UCSC)	Хр. 4: 87.47 – 87.53 Mb	Хр. 5: 104.23 – 104.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPARCL1 (англ. SPARC like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 75 208.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKTGLFFLCL		LGTAAAIPTN		ARLLSDHSKP		TAETVAPDNT		AIPSLRAEAE
ENEKETAVST		EDDSHHKAEK		SSVLKSKEES		HEQSAEQGKS		SSQELGLKDQ
EDSDGHLSVN		LEYAPTEGTL		DIKEDMSEPQ		EKKLSENTDF		LAPGVSSFTD
SNQQESITKR		EENQEQPRNY		SHHQLNRSSK		HSQGLRDQGN		QEQDPNISNG
EEEEEKEPGE		VGTHNDNQER		KTELPREHAN		SKQEEDNTQS		DDILEESDQP
TQVSKMQEDE		FDQGNQEQED		NSNAEMEEEN		ASNVNKHIQE		TEWQSQEGKT
GLEAISNHKE		TEEKTVSEAL		LMEPTDDGNT		TPRNHGVDDD		GDDDGDDGGT
DGPRHSASDD		YFIPSQAFLE		AERAQSIAYH		LKIEEQREKV		HENENIGTTE
PGEHQEAKKA		ENSSNEEETS		SEGNMRVHAV		DSCMSFQCKR		GHICKADQQG
KPHCVCQDPV		TCPPTKPLDQ		VCGTDNQTYA		SSCHLFATKC		RLEGTKKGHQ
LQLDYFGACK		SIPTCTDFEV		IQFPLRMRDW		LKNILMQLYE		ANSEHAGYLN
EKQRNKVKKI		YLDEKRLLAG		DHPIDLLLRD		FKKNYHMYVY		PVHWQFSELD
QHPMDRVLTH		SELAPLRASL		VPMEHCITRF		FEECDPNKDK		HITLKEWGHC
FGIKEEDIDE		NLLF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Girard J.-P., Springer T.A. (1995). Cloning from purified high endothelial venule cells of hevin, a close relative of the antiadhesive extracellular matrix protein SPARC. Immunity. 2: 113—123. PMID 7600298 DOI:10.1016/1074-7613(95)90083-7
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 4