TJP1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TJP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи TJP1, ZO-1, Tight junction protein 1
Зовнішні ІД OMIM: 601009 MGI: 98759 HomoloGene: 2445 GeneCards: TJP1
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001163574
NM_009386
RefSeq (білок)
NP_001157046
NP_033412
Локус (UCSC) Хр. 15: 29.7 – 29.97 Mb Хр. 7: 64.95 – 65.18 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TJP1 (англ. Tight junction protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 748 амінокислот, а молекулярна маса — 195 459[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSARAAAAKSTAMEETAIWEQHTVTLHRAPGFGFGIAISGGRDNPHFQSG
ETSIVISDVLKGGPAEGQLQENDRVAMVNGVSMDNVEHAFAVQQLRKSGK
NAKITIRRKKKVQIPVSRPDPEPVSDNEEDSYDEEIHDPRSGRSGVVNRR
SEKIWPRDRSASRERSLSPRSDRRSVASSQPAKPTKVTLVKSRKNEEYGL
RLASHIFVKEISQDSLAARDGNIQEGDVVLKINGTVTENMSLTDAKTLIE
RSKGKLKMVVQRDERATLLNVPDLSDSIHSANASERDDISEIQSLASDHS
GRSHDRPPRRSRSRSPDQRSEPSDHSRHSPQQPSNGSLRSRDEERISKPG
AVSTPVKHADDHTPKTVEEVTVERNEKQTPSLPEPKPVYAQVGQPDVDLP
VSPSDGVLPNSTHEDGILRPSMKLVKFRKGDSVGLRLAGGNDVGIFVAGV
LEDSPAAKEGLEEGDQILRVNNVDFTNIIREEAVLFLLDLPKGEEVTILA
QKKKDVYRRIVESDVGDSFYIRTHFEYEKESPYGLSFNKGEVFRVVDTLY
NGKLGSWLAIRIGKNHKEVERGIIPNKNRAEQLASVQYTLPKTAGGDRAD
FWRFRGLRSSKRNLRKSREDLSAQPVQTKFPAYERVVLREAGFLRPVTIF
GPIADVAREKLAREEPDIYQIAKSEPRDAGTDQRSSGIIRLHTIKQIIDQ
DKHALLDVTPNAVDRLNYAQWYPIVVFLNPDSKQGVKTMRMRLCPESRKS
ARKLYERSHKLRKNNHHLFTTTINLNSMNDGWYGALKEAIQQQQNQLVWV
SEGKADGATSDDLDLHDDRLSYLSAPGSEYSMYSTDSRHTSDYEDTDTEG
GAYTDQELDETLNDEVGTPPESAITRSSEPVREDSSGMHHENQTYPPYSP
QAQPQPIHRIDSPGFKPASQQKAEASSPVPYLSPETNPASSTSAVNHNVN
LTNVRLEEPTPAPSTSYSPQADSLRTPSTEAAHIMLRDQEPSLSSHVDPT
KVYRKDPYPEEMMRQNHVLKQPAVSHPGHRPDKEPNLTYEPQLPYVEKQA
SRDLEQPTYRYESSSYTDQFSRNYEHRLRYEDRVPMYEEQWSYYDDKQPY
PSRPPFDNQHSQDLDSRQHPEESSERGYFPRFEEPAPLSYDSRPRYEQAP
RASALRHEEQPAPGYDTHGRLRPEAQPHPSAGPKPAESKQYFEQYSRSYE
QVPPQGFTSRAGHFEPLHGAAAVPPLIPSSQHKPEALPSNTKPLPPPPTQ
TEEEEDPAMKPQSVLTRVKMFENKRSASLETKKDVNDTGSFKPPEVASKP
SGAPIIGPKPTSQNQFSEHDKTLYRIPEPQKPQLKPPEDIVRSNHYDPEE
DEEYYRKQLSYFDRRSFENKPPAHIAASHLSEPAKPAHSQNQSNFSSYSS
KGKPPEADGVDRSFGEKRYEPIQATPPPPPLPSQYAQPSQPVTSASLHIH
SKGAHGEGNSVSLDFQNSLVSKPDPPPSQNKPATFRPPNREDTAQAAFYP
QKSFPDKAPVNGTEQTQKTVTPAYNRFTPKPYTSSARPFERKFESPKFNH
NLLPSETAHKPDLSSKTPTSPKTLVKSHSLAQPPEFDSGVETFSIHAEKP
KYQINNISTVPKAIPVSPSAVEEDEDEDGHTVVATARGIFNSNGGVLSSI
ETGVSIIIPQGAIPEGVEQEIYFKVCRDNSILPPLDKEKGETLLSPLVMC
GPHGLKFLKPVELRLPHCDPKTWQNKCLPGDPNYLVGANCVSVLIDHF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • D'Atri F., Nadalutti F., Citi S. (2002). Evidence for a functional interaction between cingulin and ZO-1 in cultured cells. J. Biol. Chem. 277: 27757—27764. PMID 12023291 DOI:10.1074/jbc.M203717200
  • Sallee J.L., Burridge K. (2009). Density-enhanced phosphatase 1 regulates phosphorylation of tight junction proteins and enhances barrier function of epithelial cells. J. Biol. Chem. 284: 14997—15006. PMID 19332538 DOI:10.1074/jbc.M901901200
  • Fanning A.S., Lye M.F., Anderson J.M., Lavie A. (2007). Domain swapping within PDZ2 is responsible for dimerization of ZO proteins. J. Biol. Chem. 282: 37710—37716. PMID 17928286 DOI:10.1074/jbc.M707255200
  • Chen J., Pan L., Wei Z., Zhao Y., Zhang M. (2008). Domain-swapped dimerization of ZO-1 PDZ2 generates specific and regulatory connexin43-binding sites. EMBO J. 27: 2113—2123. PMID 18636092 DOI:10.1038/emboj.2008.138
  • Lye M.F., Fanning A.S., Su Y., Anderson J.M., Lavie A. (2010). Insights into regulated ligand binding sites from the structure of ZO-1 Src homology 3-guanylate kinase module. J. Biol. Chem. 285: 13907—13917. PMID 20200156 DOI:10.1074/jbc.M109.093674

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11827 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q07157 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також