Гістидил-тРНК-синтаза

HARS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X59, 2LW7, 4G84, 4G85, 4PHC, 4X5O
Ідентифікатори
Символи	HARS1, HRS, USH3B, CMT2W, histidyl-tRNA synthetase, HARS, histidyl-tRNA synthetase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142810 MGI: 108087 HomoloGene: 1592 GeneCards: HARS1
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • ligase activity • ATP binding • histidine-tRNA ligase activity • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондрія • гіалоплазма Біологічний процес • tRNA aminoacylation for protein translation • Біосинтез білків • mitochondrial translation • histidyl-tRNA aminoacylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3035	15115
Ensembl	ENSG00000170445	ENSMUSG00000001380
UniProt	P12081	Q61035
RefSeq (мРНК)	NM_002109 NM_001258040 NM_001258041 NM_001258042 NM_001289092 NM_001289093 NM_001289094	NM_008214
RefSeq (білок)	NP_001244969 NP_001244970 NP_001244971 NP_001276021 NP_001276022 NP_001276023 NP_002100	NP_032240
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.67 – 140.69 Mb	Хр. 18: 36.9 – 36.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Гістидил-тРНК-синтаза (англ. Histidyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном HARS, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 57 411.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAERAALEEL		VKLQGERVRG		LKQQKASAEL		IEEEVAKLLK		LKAQLGPDES
KQKFVLKTPK		GTRDYSPRQM		AVREKVFDVI		IRCFKRHGAE		VIDTPVFELK
ETLMGKYGED		SKLIYDLKDQ		GGELLSLRYD		LTVPFARYLA		MNKLTNIKRY
HIAKVYRRDN		PAMTRGRYRE		FYQCDFDIAG		NFDPMIPDAE		CLKIMCEILS
SLQIGDFLVK		VNDRRILDGM		FAICGVSDSK		FRTICSSVDK		LDKVSWEEVK
NEMVGEKGLA		PEVADRIGDY		VQQHGGVSLV		EQLLQDPKLS		QNKQALEGLG
DLKLLFEYLT		LFGIDDKISF		DLSLARGLDY		YTGVIYEAVL		LQTPAQAGEE
PLGVGSVAAG		GRYDGLVGMF		DPKGRKVPCV		GLSIGVERIF		SIVEQRLEAL
EEKIRTTETQ		VLVASAQKKL		LEERLKLVSE		LWDAGIKAEL		LYKKNPKLLN
QLQYCEEAGI		PLVAIIGEQE		LKDGVIKLRS		VTSREEVDVR		REDLVEEIKR
RTGQPLCIC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до аміноацил-тРНК-синтетаз 2-го класу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Tsui F.W.L., Siminovitch L. (1987). Isolation, structure and expression of mammalian genes for histidyl-tRNA synthetase. Nucleic Acids Res. 15: 3349—3367. PMID 3554142 DOI:10.1093/nar/15.8.3349
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tsui H.W., Mok S., de Souza L., Martin A., Tsui F.W.L. (1993). Transcriptional analyses of the gene region that encodes human histidyl-tRNA synthetase: identification of a novel bidirectional regulatory element. Gene. 131: 201—208. PMID 8406012 DOI:10.1016/0378-1119(93)90294-D
• O'Hanlon T.P., Raben N., Miller F.W. (1995). A novel gene oriented in a head-to-head configuration with the human histidyl-tRNA synthetase (HRS) gene encodes an mRNA that predicts a polypeptide homologous to HRS. Biochem. Biophys. Res. Commun. 210: 556—566. PMID 7755634 DOI:10.1006/bbrc.1995.1696

Див. також

• Хромосома 5