CAST

CAST
Ідентифікатори
Символи	CAST, BS-17, PLACK, calpastatin
Зовнішні ІД	OMIM: 114090 MGI: 1098236 HomoloGene: 7658 GeneCards: CAST
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • endopeptidase inhibitor activity • RNA binding • cadherin binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase inhibitor activity • protease binding Клітинна компонента • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of peptidase activity • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • inhibition of cysteine-type endopeptidase activity • presynaptic active zone organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	831	12380
Ensembl	ENSG00000153113	ENSMUSG00000021585
UniProt	P20810	P51125
RefSeq (мРНК)	NM_001042440 NM_001042441 NM_001042442 NM_001042443 NM_001042444 NM_001042445 NM_001042446 NM_001190442 NM_001284212 NM_001284213 NM_001750 NM_173060 NM_173061 NM_173062 NM_173063 NM_001330626 NM_001330627 NM_001330628 NM_001330629 NM_001330630 NM_001330631 NM_001330632 NM_001330633 NM_001330634 NM_001375317	NM_001301153 NM_001301155 NM_001301156 NM_001301157 NM_001301158 NM_001301160 NM_001301181 NM_009817
RefSeq (білок)	NP_001035905 NP_001035906 NP_001035907 NP_001035908 NP_001035909 NP_001035910 NP_001035911 NP_001177371 NP_001271141 NP_001271142 NP_001317555 NP_001317556 NP_001317557 NP_001317558 NP_001317559 NP_001317560 NP_001317561 NP_001317562 NP_001317563 NP_001741 NP_775083 NP_001362246	NP_001288082 NP_001288084 NP_001288085 NP_001288086 NP_001288087 NP_001288089 NP_001288110 NP_033947
Локус (UCSC)	Хр. 5: 96.53 – 96.78 Mb	Хр. 13: 74.84 – 74.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAST (англ. Calpastatin) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 76 573.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPTETKAIP		VSQQMEGPHL		PNKKKHKKQA		VKTEPEKKSQ		STKLSVVHEK
KSQEGKPKEH		TEPKSLPKQA		SDTGSNDAHN		KKAVSRSAEQ		QPSEKSTEPK
TKPQDMISAG		GESVAGITAI		SGKPGDKKKE		KKSLTPAVPV		ESKPDKPSGK
SGMDAALDDL		IDTLGGPEET		EEENTTYTGP		EVSDPMSSTY		IEELGKREVT
IPPKYRELLA		KKEGITGPPA		DSSKPIGPDD		AIDALSSDFT		CGSPTAAGKK
TEKEESTEVL		KAQSAGTVRS		AAPPQEKKRK		VEKDTMSDQA		LEALSASLGT
RQAEPELDLR		SIKEVDEAKA		KEEKLEKCGE		DDETIPSEYR		LKPATDKDGK
PLLPEPEEKP		KPRSESELID		ELSEDFDRSE		CKEKPSKPTE		KTEESKAAAP
APVSEAVCRT		SMCSIQSAPP		EPATLKGTVP		DDAVEALADS		LGKKEADPED
GKPVMDKVKE		KAKEEDREKL		GEKEETIPPD		YRLEEVKDKD		GKPLLPKESK
EQLPPMSEDF		LLDALSEDFS		GPQNASSLKF		EDAKLAAAIS		EVVSQTPAST
TQAGAPPRDT		SQSDKDLDDA		LDKLSDSLGQ		RQPDPDENKP		MEDKVKEKAK
AEHRDKLGER		DDTIPPEYRH		LLDDNGQDKP		VKPPTKKSED		SKKPADDQDP
IDALSGDLDS		CPSTTETSQN		TAKDKCKKAA		SSSKAPKNGG		KAKDSAKTTE
ETSKPKDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібітор тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Despres N., Talbot G., Plouffe B., Boire G., Menard H.A. (1995). Detection and expression of a cDNA clone that encodes a polypeptide containing two inhibitory domains of human calpastatin and its recognition by rheumatoid arthritis sera. J. Clin. Invest. 95: 1891—1896. PMID 7706496 DOI:10.1172/JCI117870
• Wang L.F., Wei S.G., Miao S.Y., Liu Q.Y., Koide S.S. (1994). Calpastatin gene in human testis. Biochem. Mol. Biol. Int. 33: 245—252. PMID 7951045

Див. також

• Хромосома 5