PTK7

PTK7
Ідентифікатори
Символи	PTK7, CCK-4, CCK4, protein tyrosine kinase 7 (inactive)
Зовнішні ІД	OMIM: 601890 MGI: 1918711 HomoloGene: 43672 GeneCards: PTK7
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • focal adhesion • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • integral component of plasma membrane Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • cellular response to retinoic acid • ventricular septum development • convergent extension • establishment of planar polarity • Загоєння ран • Wnt signaling pathway • coronary vasculature development • planar cell polarity pathway involved in neural tube closure • protein phosphorylation • heart development • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • адгезія клітин • neural tube closure • axis elongation • cochlea morphogenesis • positive regulation of neuron projection development • canonical Wnt signaling pathway • lung-associated mesenchyme development • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5754	71461
Ensembl	ENSG00000112655	ENSMUSG00000023972
UniProt	Q13308	Q8BKG3
RefSeq (мРНК)	NM_001270398 NM_002821 NM_152880 NM_152881 NM_152882 NM_152883	NM_175168
RefSeq (білок)	NP_001257327 NP_002812 NP_690619 NP_690620 NP_690621	NP_780377
Локус (UCSC)	Хр. 6: 43.08 – 43.16 Mb	Хр. 17: 46.88 – 46.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTK7 (англ. Protein tyrosine kinase 7 (inactive)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 070 амінокислот, а молекулярна маса — 118 392.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAARGSPAR		PRRLPLLSVL		LLPLLGGTQT		AIVFIKQPSS		QDALQGRRAL
LRCEVEAPGP		VHVYWLLDGA		PVQDTERRFA		QGSSLSFAAV		DRLQDSGTFQ
CVARDDVTGE		EARSANASFN		IKWIEAGPVV		LKHPASEAEI		QPQTQVTLRC
HIDGHPRPTY		QWFRDGTPLS		DGQSNHTVSS		KERNLTLRPA		GPEHSGLYSC
CAHSAFGQAC		SSQNFTLSIA		DESFARVVLA		PQDVVVARYE		EAMFHCQFSA
QPPPSLQWLF		EDETPITNRS		RPPHLRRATV		FANGSLLLTQ		VRPRNAGIYR
CIGQGQRGPP		IILEATLHLA		EIEDMPLFEP		RVFTAGSEER		VTCLPPKGLP
EPSVWWEHAG		VRLPTHGRVY		QKGHELVLAN		IAESDAGVYT		CHAANLAGQR
RQDVNITVAT		VPSWLKKPQD		SQLEEGKPGY		LDCLTQATPK		PTVVWYRNQM
LISEDSRFEV		FKNGTLRINS		VEVYDGTWYR		CMSSTPAGSI		EAQARVQVLE
KLKFTPPPQP		QQCMEFDKEA		TVPCSATGRE		KPTIKWERAD		GSSLPEWVTD
NAGTLHFARV		TRDDAGNYTC		IASNGPQGQI		RAHVQLTVAV		FITFKVEPER
TTVYQGHTAL		LQCEAQGDPK		PLIQWKGKDR		ILDPTKLGPR		MHIFQNGSLV
IHDVAPEDSG		RYTCIAGNSC		NIKHTEAPLY		VVDKPVPEES		EGPGSPPPYK
MIQTIGLSVG		AAVAYIIAVL		GLMFYCKKRC		KAKRLQKQPE		GEEPEMECLN
GGPLQNGQPS		AEIQEEVALT		SLGSGPAATN		KRHSTSDKMH		FPRSSLQPIT
TLGKSEFGEV		FLAKAQGLEE		GVAETLVLVK		SLQSKDEQQQ		LDFRRELEMF
GKLNHANVVR		LLGLCREAEP		HYMVLEYVDL		GDLKQFLRIS		KSKDEKLKSQ
PLSTKQKVAL		CTQVALGMEH		LSNNRFVHKD		LAARNCLVSA		QRQVKVSALG
LSKDVYNSEY		YHFRQAWVPL		RWMSPEAILE		GDFSTKSDVW		AFGVLMWEVF
THGEMPHGGQ		ADDEVLADLQ		AGKARLPQPE		GCPSKLYRLM		QRCWALSPKD
RPSFSEIASA		LGDSTVDSKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

• Park S.-K., Lee H.-S., Lee S.-T. (1996). Characterization of the human full-length PTK7 cDNA encoding a receptor protein tyrosine kinase-like molecule closely related to chick KLG. J. Biochem. 119: 235—239. PMID 8882711 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021228
• Jung J.-W., Ji A.-R., Lee J., Kim U.-J., Lee S.-T. (2002). Organization of the human PTK7 gene encoding a receptor protein tyrosine kinase-like molecule and alternative splicing of its mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1579: 153—163. PMID 12427550 DOI:10.1016/S0167-4781(02)00536-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827

Див. також

• Хромосома 6