ANKIB1

ANKIB1
Ідентифікатори
Символи	ANKIB1, ankyrin repeat and IBR domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 1918047 HomoloGene: 19076 GeneCards: ANKIB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ubiquitin ligase complex Біологічний процес • protein polyubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54467	70797
Ensembl	ENSG00000001629	ENSMUSG00000040351
UniProt	Q9P2G1	Q6ZPS6
RefSeq (мРНК)	NM_019004	NM_001003909 NM_001289527 NM_001289528 NM_001289529
RefSeq (білок)	NP_061877	NP_001003909 NP_001276456 NP_001276457 NP_001276458
Локус (UCSC)	Хр. 7: 92.25 – 92.4 Mb	Хр. 5: 3.74 – 3.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ANKIB1 (англ. Ankyrin repeat and IBR domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 089 амінокислот, а молекулярна маса — 122 002.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNTTTKFRK		ALINGDENLA		CQIYENNPQL		KESLDPNTSY		GEPYQHNTPL
HYAARHGMNK		ILGTFLGRDG		NPNKRNVHNE		TSMHLLCMGP		QIMISEGALH
PRLARPTEDD		FRRADCLQMI		LKWKGAKLDQ		GEYERAAIDA		VDNKKNTPLH
YAAASGMKAC		VELLVKHGGD		LFAENENKDT		PCDCAEKQHH		KDLALNLESQ
MVFSRDPEAE		EIEAEYAALD		KREPYEGLRP		QDLRRLKDML		IVETADMLQA
PLFTAEALLR		AHDWDREKLL		EAWMSNPENC		CQRSGVQMPT		PPPSGYNAWD
TLPSPRTPRT		TRSSVTSPDE		ISLSPGDLDT		SLCDICMCSI		SVFEDPVDMP
CGHDFCRGCW		ESFLNLKIQE		GEAHNIFCPA		YDCFQLVPVD		IIESVVSKEM
DKRYLQFDIK		AFVENNPAIK		WCPTPGCDRA		VRLTKQGSNT		SGSDTLSFPL
LRAPAVDCGK		GHLFCWECLG		EAHEPCDCQT		WKNWLQKITE		MKPEELVGVS
EAYEDAANCL		WLLTNSKPCA		NCKSPIQKNE		GCNHMQCAKC		KYDFCWICLE
EWKKHSSSTG		GYYRCTRYEV		IQHVEEQSKE		MTVEAEKKHK		RFQELDRFMH
YYTRFKNHEH		SYQLEQRLLK		TAKEKMEQLS		RALKETEGGC		PDTTFIEDAV
HVLLKTRRIL		KCSYPYGFFL		EPKSTKKEIF		ELMQTDLEMV		TEDLAQKVNR
PYLRTPRHKI		IKAACLVQQK		RQEFLASVAR		GVAPADSPEA		PRRSFAGGTW
DWEYLGFASP		EEYAEFQYRR		RHRQRRRGDV		HSLLSNPPDP		DEPSESTLDI
PEGGSSSRRP		GTSVVSSASM		SVLHSSSLRD		YTPASRSENQ		DSLQALSSLD
EDDPNILLAI		QLSLQESGLA		LDEETRDFLS		NEASLGAIGT		SLPSRLDSVP
RNTDSPRAAL		SSSELLELGD		SLMRLGAEND		PFSTDTLSSH		PLSEARSDFC
PSSSDPDSAG		QDPNINDNLL		GNIMAWFHDM		NPQSIALIPP		ATTEISADSQ
LPCIKDGSEG		VKDVELVLPE		DSMFEDASVS		EGRGTQIEEN		PLEENILAGE
AASQAGDSGN		EAANRGDGSD		VSSQTPQTSS		DWLEQVHLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7