CDH11

CDH11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2A4C, 2A4E
Ідентифікатори
Символи	CDH11, CAD11, CDHOB, OB, OSF-4, cadherin 11, ESWS, TBHS2
Зовнішні ІД	OMIM: 600023 MGI: 99217 HomoloGene: 1361 GeneCards: CDH11
Пов'язані генетичні захворювання
branchioskeletogenital syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • екзосома • cell surface • catenin complex • синапс • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • skeletal system development • adherens junction organization • Осифікація • corticospinal tract morphogenesis • адгезія клітин • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • modulation of chemical synaptic transmission • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1009	12552
Ensembl	ENSG00000140937	ENSMUSG00000031673
UniProt	P55287	P55288
RefSeq (мРНК)	NM_001308392 NM_001797 NM_001330576 NM_033664	NM_009866
RefSeq (білок)	NP_001295321 NP_001317505 NP_001788	NP_033996
Локус (UCSC)	Хр. 16: 64.94 – 65.13 Mb	Хр. 8: 103.36 – 103.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH11 (англ. Cadherin 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 87 965.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKENYCLQAA		LVCLGMLCHS		HAFAPERRGH		LRPSFHGHHE		KGKEGQVLQR
SKRGWVWNQF		FVIEEYTGPD		PVLVGRLHSD		IDSGDGNIKY		ILSGEGAGTI
FVIDDKSGNI		HATKTLDREE		RAQYTLMAQA		VDRDTNRPLE		PPSEFIVKVQ
DINDNPPEFL		HETYHANVPE		RSNVGTSVIQ		VTASDADDPT		YGNSAKLVYS
ILEGQPYFSV		EAQTGIIRTA		LPNMDREAKE		EYHVVIQAKD		MGGHMGGLSG
TTKVTITLTD		VNDNPPKFPQ		SVYQMSVSEA		AVPGEEVGRV		KAKDPDIGEN
GLVTYNIVDG		DGMESFEITT		DYETQEGVIK		LKKPVDFETK		RAYSLKVEAA
NVHIDPKFIS		NGPFKDTVTV		KISVEDADEP		PMFLAPSYIH		EVQENAAAGT
VVGRVHAKDP		DAANSPIRYS		IDRHTDLDRF		FTINPEDGFI		KTTKPLDREE
TAWLNITVFA		AEIHNRHQEA		KVPVAIRVLD		VNDNAPKFAA		PYEGFICESD
QTKPLSNQPI		VTISADDKDD		TANGPRFIFS		LPPEIIHNPN		FTVRDNRDNT
AGVYARRGGF		SRQKQDLYLL		PIVISDGGIP		PMSSTNTLTI		KVCGCDVNGA
LLSCNAEAYI		LNAGLSTGAL		IAILACIVIL		LVIVVLFVTL		RRQKKEPLIV
FEEEDVRENI		ITYDDEGGGE		EDTEAFDIAT		LQNPDGINGF		IPRKDIKPEY
QYMPRPGLRP		APNSVDVDDF		INTRIQEADN		DPTAPPYDSI		QIYGYEGRGS
VAGSLSSLES		ATTDSDLDYD		YLQNWGPRFK		KLADLYGSKD		TFDDDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
• Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Див. також

• Хромосома 16